藥師琉璃光如來本願功德拔除一切業障修持課儀
——依弘一大師所述程式增補
一、皈敬祈請
南無十方三世一切諸佛。南無十方三世一切正法。南無十方三世一切聖僧。
南無本師釋迦牟尼佛。
南無善名稱吉祥王如來。南無寶月智嚴光音自在王如來。
南無金色寶光妙行成就如來。南無無憂最勝吉祥如來。
南無法海雷音如來。南無法海勝慧遊戲神通如來。
南無藥師琉璃光如來。南無日光遍照菩薩。南無月光遍照菩薩。
南無文殊師利菩薩。南無觀世音菩薩。南無得大勢菩薩。南無無盡意菩薩。
南無寶壇華菩薩。南無藥王菩薩。南無藥上菩薩。南無彌勒菩薩。
奉請宮毘羅大將。奉請伐折羅大將。奉請迷企羅大將。奉請安底羅大將。
奉請頞你羅大將。奉請珊底羅大將。奉請因達羅大將。奉請波夷羅大將。
奉請摩虎羅大將。奉請真達羅大將。奉請招杜羅大將。奉請毘羯羅大將。
一一各有七千藥叉以為眷屬。降臨壇場。衛護行者。解脫一切苦難。諸有願求。悉令滿足。
（十方三寶一拜，或分禮佛法僧三拜。本師釋迦牟尼佛一拜。藥師琉璃光如來三拜。此外若欲多拜，或兼禮敬其他佛菩薩者，隨己意增加。禮敬之時，須至誠恭敬，緩緩拜起，萬不可匆忙。寧可少拜。不可草率。）
二、稱讚如來（禮敬既畢，於佛前長跪合掌，唱贊偈云：）
歸命滿月界。淨妙琉璃尊。法藥救人天。因中十二願
慈悲弘誓廣。願度諸含生。我今申讚揚。志心頭面禮
（贊偈出《藥師如來消災除難念誦儀軌》。唱贊之時，聲宜遲緩，宜莊重。）
三、廣修供養（讚嘆既畢，於佛前長脆合掌，唱供養偈云：）
願此香花雲。遍滿十方界。一一諸佛土。無量香莊嚴。具足菩薩道。成就如來香
（供養畢，或隨己意增誦懺悔文，或可略之。）
四、懺悔業障
往昔所造諸惡業。皆由無始貪瞋痴。 從身語意之所生。一切我今皆懺悔
五、本願功德（按：隨個人時間允許，可擇廣中略三種修法。廣法可念藥師全經、中法念十二大願文、略法只稱念經題）
（經題）南無藥師琉璃光如來本願功德十二神將饒益有情結願神咒拔除一切業障經
佛告曼殊室利：「東方去此過十殑伽沙等佛土，有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來、應、正等覺、明行圓滿、善逝、世間解、無上丈夫、調御士、天人師、佛、薄伽梵。曼殊室利！彼佛世尊藥師琉璃光如來，本行菩薩道時，發十二大願，令諸有情，所求皆得。
「第一大願：願我來世得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明，熾然照曜無量無數無邊世界，以三十二大丈夫相、八十隨好，莊嚴其身；令一切有情，如我無異。」
「第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過於日月；幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。」
「第三大願：願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情，皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。」
「第四大願：願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令安住菩提道中；若行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立之。」
「第五大願：願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒。設有毀犯，聞我名已，還得清淨，不墮惡趣。」
「第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，醜陋、頑愚、盲、聾、瘖、啞、攣、躄、背僂、白癩、癲狂、種種病苦；聞我名已，一切皆得端正黠慧。諸根完具，無諸疾苦。」
「第七大願：願我來世得菩提時，若諸有情，眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號，一經其耳，病悉得除，身心安樂，家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提。」
「第八大願：願我來世得菩提時，若有女人，為女百惡之所逼惱，極生厭離，願舍女身；聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。」
「第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情，出魔罥網，解脫一切外道纏縛；若墮種種惡見稠林，皆當引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提。」
「第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情，王法所錄，縲縛鞭撻，系閉牢獄，或當刑戮，及余無量災難凌辱，悲愁煎迫，身心受苦；若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。」
「第十一大願：願我來世得菩提時，若諸有情，饑渴所惱，為求食故造諸惡業；得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食，飽足其身；後以法味，畢竟安樂而建立之。
「第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情，貧無衣服，蚊虻寒熱，晝夜逼惱；若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。」
「曼殊室利！是為彼世尊藥師琉璃光如來、應、正等覺，行菩薩道時，所發十二微妙上願。」
（字音不可訛誤，宜詳考之。誦經時，或跪或立或坐或經行皆可。）
六、一行三昧
前行：
般若波羅蜜多心經（若善男子善女人。欲入一行三昧。當先聞般若波羅蜜如說修學。然後能入一行三昧。如法界緣。不退不壞。不思議無礙無相。）
觀自在菩薩，行深般若波羅蜜多時，照見五蘊皆空，度一切苦厄。舍利子，色不異空，空不異色，色即是空，空即是色，受想行識亦復如是。舍利子是諸法空相，不生不滅，不垢不淨，不增不減，是故空中無色，無受想行識，無眼耳鼻舌身意，無色身香味觸法，無眼界，乃至無意識界，無無明，亦無無明盡，乃至無老死，亦無老死盡，無苦集滅道，無智亦無得，以無所得故，菩提薩埵。依般若波羅蜜多故，心無罣礙，無罣礙故，無有恐怖，遠離顛倒夢想，究竟涅盤。三世諸佛，依般若波羅蜜多故，得阿耨多羅三藐三菩提，故知般若波羅蜜多是大神咒，是大明咒，是無上咒，是無等等咒，能除一切苦，真實不虛，故說般若波羅多咒，即說咒曰：「揭諦，揭諦，波羅揭諦，波羅僧揭諦，菩提薩婆訶。」（三遍，最後一遍念般若心咒21遍）（先唱贊偈云：）
正行：
藥師如來琉璃光。焰網莊嚴無等倫。 無邊行願利有情。各遂所求皆不退
（續雲）「南無東方淨琉璃世界藥師琉璃光如來。」
（以後即持念）「南無藥師琉璃光如來（或南無藥師琉璃光佛）」（名號108遍。若欲多念者，隨意。）
七、光明灌頂藥師琉璃光如來得菩提時。由本願力觀諸有情。
遇眾病苦。瘦瘧乾消。黃熱等病。或被厭魅。蠱道所中。
或復短命。或時橫死。欲令是等。病苦消除。所求願滿。
時彼世尊。入三摩地。名曰：滅除一切眾生苦惱。
既入定已。於肉髻中出大光明。光中演說大陀羅尼咒曰
南謨薄伽伐帝鞞殺社窶嚕薜琉璃缽喇婆曷囉闍也呾他揭多也
阿囉喝帝三藐三勃陀也 呾侄他
唵鞞殺逝鞞殺逝鞞殺社三沒揭帝莎訶（3或7或21或108遍）
爾時光中。說此咒已。大地震動。放大光明。
一切眾生。病苦皆除。受安隱樂。
（加持物品時念）弟子○○○至誠祈求大慈大悲藥師琉璃光如來及藥師海會諸大聖眾，不違本誓，憐憫有情，加持此藥 (或食物或純水或病人◎◎◎)令◎◎◎及法界一切有情眾生，病苦消除，身心健康，壽命延長。
（若見男子女人有病苦者。應當一心為彼病人清淨澡漱或食或藥或無蟲水咒一百八遍與彼服食。所有病苦悉皆消滅。）（若有受持此真言。能拔身中過去生死一切重罪。不復經歷三途。免離九橫超越眾苦。十方世界隨處安樂。自在無礙法應如是。）
（或據經中譯音持念，或別依師學梵文原音持念，皆可。或念全咒一百八遍。或先念全咒七遍，繼念心咒一百八遍，後復念全咒七遍。心咒者，即是咒中『唵』字以下之文。未經密宗阿闍黎傳授，不可結手印。擅結者，有大罪。持咒時，不宜大聲，惟令自己耳中得聞。持咒時，以坐為正式，或經行亦可。）
八、回向發願
佛光注照○○○（稱自己名或他人名）本命元辰，災星退度福星臨，九耀保長生。運限和平，福壽永康寧。
解結解結解冤結，解了多生冤和業，洗心滌慮發虔誠，今對佛前求解結。
藥師佛藥師佛、消災延壽藥師佛、隨心滿願藥師佛。（按：此句「消災延壽藥師佛」可依個人所求不同變化，如求智慧即念「開我智慧藥師佛」））
我今持誦藥師佛，即發菩提廣大願。願我定慧速圓明，願我功德皆成就。
願我勝福遍莊嚴，願共眾生成佛道。我昔所造諸惡業，皆由無始貪嗔痴。
從身語意之所生，一切我今皆懺悔。願我臨欲命終時，盡除一切諸障礙。
面見藥師琉璃光，即得往生琉璃剎。（或自己所願生之淨土，如：「面見彼佛阿彌陀，即得往生安樂剎。」）
虔誠謹奉藥師佛力，回向一切法界眾生。
降諸煩惱解冤釋結，福德盈滿智慧開顯。
業障破除劫運消滅，順心如意安樂富裕。
風調雨順國泰民安，了生脫死離苦得樂。
超凡入聖往生淨土，直登蓮台永不退轉。
圓成無上正等妙覺，悠遊十方教化九界。
自在顯化恆無疲厭，畢滿速證藥師誓願。
願以此功德，供養藥師佛，上報四重恩，下濟六道苦。
法界諸眾生，悉發菩提心，盡此一報身，同生琉璃國。（或自己所願生之淨土）
˙願藥師法興盛回向文：
祈願藥師法，大德廣弘宣，現前及當來，遍揚十方界，
法緣轉增盛，如日耀中天，一切眾生聞，佛願廣加被，
業障悉消滅，福慧皆圓滿，往生佛淨土，速得正等覺。
（以上可任擇一或兩種回向發願，或念自己習慣之回向，但皆須念「願藥師法興盛回向文」以總結。）
（回向與發願大同，故今並舉。其稍異者，回向須先修功德，再以此功德回向，惟願如何云云。若先未修功德者，僅可雲發願也。回向發願，為修持者最切要之事。若不回向，則前所修之功德，無所歸趣。今修持藥師如來法門者，回向之願，各隨己意。凡《藥師經》中所載者，皆可發之，應詳閱經文，自適其宜可耳。
以上所述之修持課儀，每日行一次或二次三次。必須至心誠懇，未可潦草塞責。印光老法師云：「有一分恭敬，得一分利益，有十分恭敬，得十分利益」。吾人修持藥師如來法門者，應深味斯言，以自求多福也。）
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附註：以上括弧內為說明文字皆無須念。
建議行者在回向之前最好誦念下段句子：一心祈請法身觀世音菩薩（或一心祈請南無法身○○○佛菩薩作主(三稱)，可迎請您所信仰的佛菩薩），作主，願將今日所修(包括任何聖號經咒及所做......等)功德回向給......。
一般性回向範例：
一心啟請法身觀世音菩薩（或所祈求的佛菩薩）作主：
願以此功德 供養三寶尊 上報四重恩 下濟六道苦
法界諸眾生 悉發菩提心 盡此一報身 同生極樂國
再以此功德回向弟子身體健康、病體速愈、業障消除、福慧增長、解冤釋結、常住安樂、吉祥圓滿。（綜合型回向(供養三寶+回向法界+求生極樂淨土)→個人願求）
專供解冤釋結型回向範例：
「因果生生報不停，惡緣孽債兩相尋，從今解脫千年結，善道頻開福德門。無上解冤結菩薩摩訶薩。」（三遍）
以下擇其中一種回向：
【無指定的冤親債主（泛指無形的業障）的回向】：
一心祈請南無大慈大悲阿彌陀佛（或所祈求的佛菩薩）、南無無上解冤結菩薩慈悲作主。（三稱三拜），弟子○○○今日願與我的冤親債主、無形業障懺悔往昔所造諸惡業，並將此修法功德回向超度我的冤親債主、無形業障，願仰仗佛力的加持，化解祂們心中的怨恨、身心的痛苦，並幫助祂們離苦得樂，破迷開悟、往生淨土。（此回向解冤釋結的效果最大）
【無指定的冤親債主（泛指無形的業障）的回向】：
「一心祈求大悲觀世音菩薩（或所祈求的佛菩薩）作主：願以此功德回向超度弟子的冤親債主、無形業障，解冤釋結，轉惡緣為善緣，離苦得樂、往生淨土。」
【特別針對造成某一部份業力（如病苦、情苦或人生種種苦難等）的冤親債主回向】：
「一心祈求大悲觀世音菩薩（或所祈求的佛菩薩）作主：願以此功德回向超度造成弟子（病苦、情苦或人生種種苦難等）的冤親債主、無形業障，解冤釋結，轉惡緣為善緣，離苦得樂、往生淨土。」
【針對現世的冤親債主（如家人、同事等不合之對象）的回向】：
「一心祈求大悲觀世音菩薩（或所祈求的佛菩薩）作主：願以此功德二分之一回向弟子與OOO解冤釋結，轉惡緣為善緣，二分之一回向超度我所背負的冤親債主、無形業障解冤釋結、離苦得樂、往生淨土。」
【個人祈願】：
1.若求身體健康：再以此功德回向xxx身體健康、業障消除，息除一切身心諸患、所求一切世出世間善願皆能速疾圓成。
2.若求度亡：再以此功德回向xxx(往生者)蒙佛接引、業障消除、善業增長，隨願往生佛國淨土。
3.若求消業增福：再以此功德回向xxx蒙佛加持、業障消除、福慧增長、常遇善友、親近佛法、得廣大守護之力及怨親和稅、諸願圓成、柔伏一切障難、若求富貴吉祥、豐隆財福、所求如意自在、得大解脫。
4.若求吉祥如意：再以此功德回向xxx吉祥如意，蒙佛菩薩晝夜護念，平安順利、所求如願、吉祥圓滿。
5.若求佛法：再以此功德回向xxx，親近佛法、得善知識引導，自然發起廣大菩提心、速證菩提，成就佛果。
6.若求學業：再以此功德回向xxx考試順利、增長智慧、金榜提名，蒙佛加被，常安於智慧光明中、避除一切障難、思路靈敏、心神安定、離諸布畏、善願圓滿。
7.若求人緣、愛情：再以此功德回向xxx能人天敬愛，柔伏一切障難、威權具足、得善諸緣、外緣圓滿，所求自在。
8.若求財運：再以此功德回向xxx財源富足、福德增長、受用無缺、運程順遂、所求圓滿。
9.綜合求願：再以此功德回向弟子身體健康、病體速愈、業障消除、福慧增長、解冤釋結、常住安樂、吉祥圓滿。