複次曼殊室利。若諸有情。好喜乖離更相鬥訟惱亂自他。
以身語意造諸惡業。展轉常為不饒益事。
互相謀害告召山林樹冢等神殺諸眾生取其血肉祭祀藥叉羅剎神等。
書怨人名或作形像。以惡咒術而咒詛之。
厭魅蠱道咒起死屍。令斷彼命及壞其身。
是諸有情若得聞此藥師琉璃光如來名號。彼諸惡緣悉不能害。
一切展轉皆起慈悲。利益安樂無.損惱意及嫌恨心。於自所有常生喜足
時彼世尊入三摩地。名曰滅除一切眾生苦惱。
既入定已。於肉髻中出大光明。光中演說大陀羅尼咒曰
南謨薄伽伐帝鞞殺社窶嚕薜琉璃缽喇婆曷羅闍也
呾他揭多也阿羅喝帝三藐三勃陀也
呾侄他
唵鞞殺逝鞞殺逝鞞殺社三沒揭帝莎訶
爾時光中說此咒已。大地震動放大光明。一切眾生病苦皆除受安隱樂。
曼殊室利。若見男子女人有病苦者。
應當一心為彼病人清淨澡漱或食或藥或無蟲水咒一百八遍與彼服食。
所有病苦悉皆消滅。若有所求指心念誦。皆得如意無病延年。
命終之後生彼世界。得不退轉。乃至菩提。
是故曼殊室利若有男子女人。於彼藥師琉璃光如來。
至心殷重恭敬供養者。常持此咒勿令廢忘
藥師咒義:
<南謨>譯皈依,或敬禮.
<薄伽伐帝>,即薄伽梵,世尊之義.
<鞞殺社窶嚕>,即藥師.
<薜琉璃缽喇婆曷羅闍也>,即琉璃光.
<呾他揭多也>,即如來.
<阿羅喝帝>,譯應,即應供.
<三藐三勃陀也>,譯正等正覺.
故連合之,即<皈依世尊藥師琉璃光如來應供正等正覺>.
<呾侄他>乃是即說咒曰之義.
自唵至莎訶,方是藥師咒之正文
<唵>字應讀<翁>音
咒為總持,<唵>為總持之總持,故一切經咒,皆冠以<唵>字
<鞞殺逝鞞殺逝>,為藥之,藥之之義,是醫治義,做動詞用.
<鞞殺社>,為藥義,當名詞.
<鞞殺逝鞞殺逝鞞殺社>,合為<以藥藥之>之藥.
<三沒揭帝>,即普度之義.
<莎訶>,為速疾成就之義.
故連合之,即<以藥普渡一切眾生病苦之大願速得成就>.
全咒之義為
<皈依世尊藥師琉璃光如來應供正等正覺
以藥普渡一切眾生病苦之大願速得成就>
節錄自<藥師本願經講記>-太虛大師著
南無佛陀耶南無達摩耶南無僧伽耶