「願身口意恆清淨，諸行剎土亦復然」：我們找到了普賢菩薩之所以成為諸佛長子的秘密，即五清淨：身清淨、口清淨、意清淨、行清淨、剎土清淨。前面一句是身口意恆清淨之意，諸行剎土「亦復然」，即「也是恆時清淨」的意思。普賢菩薩以這五種清淨成為了諸佛的長子，我們現在就要學習和行持這五清淨。
普賢菩薩的身恆清淨，即無礙。身無礙，一身化現剎塵身。普賢菩薩的十大願王都是不可思議的境界，如果他的身沒有清淨，沒有做到身無礙，他能做到這些嗎?普賢菩薩的語恆清淨，即語無礙，一音流現一切音。普賢菩薩的意清淨無礙，一念當中能深入一切無緣之三摩地門，即一切禪定之門。無緣就是無有執著，三摩地指一切禪定。普賢菩薩的行恆時清淨，行無礙，在一剎那當中，可以行持六度萬行，圓滿一切菩薩的學處——菩提行。普賢菩薩的剎土恆時清淨，在一個微塵當中可以顯現整個微塵數的剎土，整個剎土中的一切微塵都是如此，無量無邊的剎土都在一剎那當中清淨莊嚴。當下都是清淨莊嚴的，一切都是清淨莊嚴的。身恆時清淨，語恆時清淨，意恆時清淨，行恆時清淨，剎土恆時清淨，這就是普賢菩薩的五清淨。
「如是智慧號普賢」：只有智慧圓滿了，才有五清淨及五無礙。否則，根本無法做到這些。
「願我與彼皆同等」：發願自己也要和普賢菩薩一樣，要學五清淨，修五清淨，圓滿五清淨，成就五清淨。這樣才可以稱為「與普賢菩薩等同」，才能和普賢菩薩一樣成為諸佛的長子。