有同修對《懺悔偈》中後幾句有疑惑：到底怎麼做才算真懺悔呢?由此引出了如下的內容。
1、罪從心起將心懺;
經文中說「心是罪源，形為罪藪」，身口意只是罪業釋放的外在部分，而罪業形成的根本在內心。佛教一直強調追本溯源得以解決問題，不是沉溺在支端末節上。
造作罪業的根源是心，那自然要懺悔心。懺悔心的什麼?一切造作罪業的機理、原因、條件等等，全部都是要羅列在懺悔中的。經文中說到「一念無明生三細，境界為緣長六粗」，在心念層面上無明的心一動，就形成三種細相(無明業相、轉相、現相)，當這三個細相產生後就隨之而來了六種粗相。我們跟隨種種粗相轉，永遠無法找到根源，也永遠不可能徹底解決這些事情，所以心是源頭，就要從心地開始解決。
各位看到我們在《普門超度》標準版里的懺悔是沒有格式性的，和懺悔文也不相同，並非懺悔文不好，而是我們對成形的東西有免疫力，看兩遍就不再深入研究了，導致成型的東西被忽略了內在力量。
心是一切的源頭：善的源頭、惡的源頭、業的源頭、罪的源頭、光明的源頭、圓滿的源頭、智慧的源頭、圓通的源頭、輪迴的源頭、痛苦的源頭。找到根本源頭才能從根本解決問題，而我們外在的肉體上的煩惱、痛苦也都是從心地釋放而來，肉體的痛苦只是錯誤心念的折射反應而已。
2、心若滅時罪亦亡;
「亡」字在古代常常用做通假字，是無意思。也就是說如果從造作罪惡的源頭解決了，這些附著在心念動盪而產生的罪業現象，也就解決了，也就沒有了。
過去舉過例子：每個眾生就像一個棍子，而眾生間的各種業力是棍子間的線，線的二頭捆綁在二個棍子上。就像你做了一個善，有一個接受善的客群，你和這個接受善的眾生就像二個棍子，而中間系了一個叫做善的繩子，惡也相同，只是系的繩子叫做惡而已，除此之外別無不同。
善惡若針對個體眾生還都是小善小惡，而如果針對的是一個大眾群體，就像一個人在講台上說話，會形成與台下所有客群的業力關係，至於業力關係是善是惡就不細論了。造作的業行，若客群群體越大，將承受的業力反饋就會越猛烈，在這種前提下，善可以成萬倍的收穫，惡業可以成萬倍的放大。
把造作業力的根本源頭縛住了，心不再如此釋放，心不再造作罪業，這罪從這個角度來說就消亡了，但這說的是不再去造作新的罪業。
3、心亡罪滅兩俱空，是則名為真懺悔。意思是：心不再造作業力了，罪業也消失不見了，這才是真正的懺悔。
如《念佛圓通章》裡的：一人專憶，一人專忘，此二人若逢不逢。就算這二人遇到了，也像沒有遇到一樣。第三句里說到了罪的三個主體中的二個都消亡了，但是還有一個第三方，也就是罪業的客群一方。這類情況還要通過修持忍辱等等承受下去，以消了此業。
如上說到二個棍子中間系了線，二個棍子是主體，線是現象，二個棍子間的關係是由線的性質預定的，如果二個棍子間的線是惡的，二個眾生遇到了就會產生惡的事件，或者被惡的事件籠罩著。
這是禪的消業方法，把自己的這個主體觀空，就像其中一個棍子消失了，那麼捆綁在上面的線自然沒地方捆，靠這種方式消除業力，還要配合忍辱才能圓滿。而如果不能真正做到把自己弄空，這種消業的方法就沒有效果。這種真正的三輪體空的懺悔確實很好，但是對當下的大眾來說，這種方法就太深了，門檻太高。現在隨便找個學佛人，不要看他說得多華麗、高大上、多微妙，能不能把自己弄空?能，那是有功夫，有戒定慧的修持。而絕大多數人是做不到這個水平的。
所以並非是這條路不通，而是對當下的我們而言走得艱難，或者很多人就是根本走不通，那麼應該考慮換個套路，換個方法去解決。如二個棍子和一個線，棍子不能改動，自己這個都弄不空，自然不可能寄希望對方的棍子忽然空掉，二個棍子都動不得，只能打打中間線的主意了。我們用方法把線剪斷，或者把線的本質改變，這就改變了二個棍子間的關係了，對不對?
懺悔的目的是什麼?懺悔的目的是要承認自己的過錯，要獲得罪業的釋解。把那些已經埋在地里的種子摳出來，不讓他發芽成長;而那些已經發芽了，或者沒及時找懺悔掉的，就會繼續成長，這就必須要承受了，要學會忍辱了;如果不能忍那就不能消，不能釋解這份怨仇，這個懺悔就是空洞的、無力量的、沒有效力的。所以懺悔當及時，而不是頻繁。我鼓勵大家懺悔自己，但是不鼓勵大家念懺悔文，為什麼呢?因為那是別人的心，不是我們的心，我們沒這樣想，就這樣念念不得利的。
怎麼懺悔才好?懺悔有幾個要素：
1、我們要真正地知道錯在哪裡。現在有的人很有意思，承認錯誤，但是錯在哪裡不知道，那麼對方是否能認可這種水平的道歉呢?大家換位思考，真的很難原諒一個不知道錯在哪裡的人。
2、道歉要真誠，以期獲得對方的諒解。懺悔的根本目的是獲得釋解，也就改變了中間的線。有的情況是釋解了就解開了，不再相互捆綁了，就了了一份業力，消了一個因果，那麼對方如何才能真正的諒解原諒呢?
3、要停止繼續傷害。如法律上說到的要停止侵害，不能說我向你道歉，但是一邊道歉一邊施加傷害，這種道歉肯定不能獲得原諒。既然知道真的錯了，就改了並不再造作;如果還再造做，對方肯定不會原諒。所以懺悔重要的內容是我們知道錯在哪裡，並且以後不再做這樣的事情，這算是從心懺了，是從心上解決了;但是停止侵害了，又道歉了，就能獲得原諒嗎?
4、要做出賠償，彌補傷害。這是懺悔的最重要的條件了，就像我們傷害了眾生，導致眾生來傷害我，這是平衡的事情。我承認錯了，也不再施加傷害了，同時給出賠償，對方是否會更容易原諒呢?
如果這4條都能做到是很容易會獲得諒解的：1是真誠，2是認錯，3是改正，4是賠償。如果前3個都做到了，有的眾生也不一定會原諒你。就像樓下的車被砸了，你真誠的承認過錯並且天打五雷轟的說不再砸車了，車主還是需要你修好車的，對不對?可是如果我們說：不給你修了，給你換個更好的吧!是否更容易獲得諒解，是否這樣做很容易消除怨恨啊?
唯有令對方獲得佛法的利益才能讓懺悔真正的圓滿。這就又回到了三位配合上了。你若真想和眾生釋解怨仇，必須承認自己的過錯，也必須回向給對方，回向的數量差不多了，再為他們超度，指引他們往生極樂的方法，這事就做圓滿了;而如果懺悔不真誠，又不知道自己錯在哪裡，還在做漫天的大回向，補償就很難到位，改正自己也沒有方向，這種懺悔只是形式，沒有力量可言。
所以說三位配合非常萬能，我們的功課回向是對眾生的懺悔賠償，但這種賠償只是損失多少補多少，沒有加倍賠償到讓他不能拒絕，《普門超度》的參與就真正的讓補償成為不可拒絕的。如說欠你幾塊錢，咱們不給了，給你黃金吧，或者鑽石，你如果知道他們的價值，會因為沒給你拿幾塊錢而糾纏不休嗎?
這一套方法在我看來是萬能的，在大家的真實使用中也會慢慢凸顯出他的效力來，大家真的需要去明白並且落實好這套系統，利益和好處不是一點半點。各位思維。