祖師的思想特點非常豐富，我簡單地概述為五點，首先，就是注重因果律。淨宗祖師宣揚的三世善惡因果原理，既可策進淨土行人的修持，又能有效地改善世道人心。
因果法則是佛教理論的一個基礎，實際上一大藏教就是談因果二字，世間和出世間的因果。無論是通途教法還是淨土教法，都要有一個深信因果的心理背景，深信因果也是淨業三福中第三福談到的。
怎麼是深信?你得要深刻的了解，然後產生敬畏感，然後行為上要有慎獨，這時候你才有一點深信的樣子。因果對於淨土修行也是必不可少的，離開了因果，我們修淨土法門是沒有根基的。
在這點上，首先我們從慧遠大師的思想來看，他就非常注重因果。那個時代他與善信們書信往來都在討論什麼問題呢?有些朝廷里的官員，覺得自己也沒做過什麼壞事，為什麼遭遇不好啊?來問這個問題，這些問題問的比較多，所以慧遠大師就寫了篇《三報論》，這篇非常重要的著作，展示因果通三世，現報、生報、後報的錯綜複雜的關係。
這一因果的思想，在東晉啟建蓮社，劉遺民居士寫西方發願文(承慧遠法師之授意)的時候，第一段談到時間、人物，這樣的引言。第二段開始，直接就談因果問題，就是大家組成這個蓮社跟因果之間的關係。
這段是這樣表述的，劉遺民居士寫到「惟斯一會之眾，夫緣化之理既明，則三世之傳顯矣;遷感之數既符，則善惡之報必矣。推交臂之潛淪，悟無常之期切;審三報之相催，知險趣之難拔。此其同志諸賢，所以夕惕宵勤，仰思攸濟者也」，把因果道理作為蓮社啟建的一個深刻基礎展示出來。
「惟斯一會」就是參加法會的蓮社同仁們，為什麼聚在一起?是由於性空緣起，化化不斷的道理明了之後，他就了解過去、現在、未來的因果法則是真實不虛的，因果裡面就有善惡報應，無論是在顯感還是冥感都是相符的，再看到自己的六親眷屬離開這個世間，就感悟到生死的無常，非常的迫切。
這種現報、生報、後報對我們生命的相催啊，就是無常死亡馬上到來的情景，了知三界六道這個有風險的地方是很難離開的，但這批有超越意向的人，又有了生脫死出輪迴的意向，所以這些同志諸賢朝夕都在思惟這件事情，怎麼能到解脫救濟的方法。
這是從因果法則所推顯出來的對輪迴的畏懼，一種解脫的期待，是由這個來緣生出來的。
所以沒有三世因果，我們學佛都沒有依據啊，如果人死燈滅的話，我們還出什麼家啊?再出家就是一件很荒唐的事情了，毫無意義啊。肯定是由於有過去，有現在，有未來，有輪迴，有解脫，出家才顯出它的意義，而在家學佛也體現出他的意義和價值，所以蓮社的建立，也是建立在因果法則上的。