安養極樂寶剎，是大覺讚嘆的，三輩眾生要高升的。晚夕中孕含金華，群星還要慚愧那海滴。晨朝的暢遊玉池，世燈勉強比喻為河沙。因為十方諸佛來贊助，四類眾生有利往。雖然光照而普遍開示，終究頂禮而偏求往生。所以天竺國的皇家，從古到今，那裡的大賢大聖們，都舒展文辭作為盟約(文殊普賢天親龍樹聖賢等類，或另譯發願文，或著作經論，這裡不詳說)，這裡的大德大儒們，盡情的揮毫而發誓願。(且首先從晉朝的東林淨社劉雷等十八賢，以及一百二十三人同發誓願。劉遺民執筆撰寫。後來有地位的人士，有德望的高僧，有潔志的俗家信眾，豐富了記載)從此反覆綿續，相互唱和。確實是道德的通途大路，常樂的直捷救濟啊。但是世間多有歪曲錯解，沒有了解深意，忽然遇到求問，就沒有羞慚的濫吹,或激動排斥為小教，或大笑指責為權乘。因為那言詞既然違反經意，人們疑惑在通常的典藉上，能不說嗎?「居其室，出其言不善。則千里之外違之，況其邇者乎」(孔子語，意思是君子在自家說出的話不善，那千里以外都違棄了，何況近處呢)，於是我就論述《往生淨土決疑行願二門》，詞語慚愧不成文采，道理還可能算是適當。看到菽和麥就要分辨，區別涇水和渭水就要分明，剪除伊蘭草的臭林，種植栴檀樹的香乾。信解行願，探求始終，不用數千言就能詳細說明的，實在是這二門了。
第一決疑門
疑是信的障礙，世間小善尚且不能成就，何況菩提大道呢?有人說：「天台智者已經有《淨土釋十疑論》，何須這篇文字?」但是大略有三個意義。一是上為王臣高官生起信願的，事務繁忙少有閒暇，難尋廣長的文字細看。現今列舉大綱，以及略說行相，因為容易閱覽，因為容易修行。二是論中多是隨著事相解釋疑難。唯有第二第三，略有附帶義理的。而且事情既然沒有窮盡，疑也不可終止。現今就闡明一理，作為諸法的源頭，指出源頭那流就可以知道了。三是正對說者反經背理，自損損他。所以在第二疑法中，舍小的取大的，弄明白權與實，使後來的人不迷惑。至於道安和尚的《往生論》(六卷)，懷感法師的《群疑論》(七卷)，道綽禪師的《安樂集》(三卷)，慈敏三藏的《淨土慈悲集》(三卷)，源信禪師的《淨土集》(二卷)，古今祖師歸心淨土的，或註疏解經，或根據經典造論。或隨機解釋疑難，或伽陀讚揚。雖然殊途同歸，而各自陳述見解，動不動就是長篇，尋究確實很難。現今統合那百家，把三疑收盡。但是文字依據是天台止觀，不敢自己臆說。一是疑師。二是疑法。三是疑自。
一是疑師
師有二種：一是邪魔外道等師，顛倒惑亂別人，不是能傳承的啊。二是正法的師，又有凡聖因果的不同。凡夫以及因位，還有不明白的，就像清辨(印度人)認為彌勒還不是正遍知，要等到龍華成佛，再去問津，就是這類啊。現今顯示西方淨土要眾生回向的，唯有果佛聖師，釋迦如來，以及十方諸佛，出廣長舌，說誠實言，贊勸往生，更有什麼迷惑?
二是疑法
佛法有二種：一是小乘不了義法。二是大乘了義法。大乘中又有了義不了義的不同。現今談淨土，是唯一大乘了義中了義的法啊。並且小乘經部，包括所有貝書，沒有過一字贊勸往生他方淨土。所以天親論說：「女人以及六根殘缺的，二乘種性的不生他方淨土。」這就是明確的根據啊。
問：小本《阿彌陀經》等，都說極樂國有聲聞弟子。以及《鼓音王經》說，佛母名叫殊勝妙顏。也應當還有女人。
答：佛母恐怕是指初降生時。成正覺後，國土隨即清淨，必沒有女人。佛母或轉成男子，如娑婆本土的龍女，或在命終如悉達多的母親。有人注論引用這部經文，而說淨土也有女人的，不是啊。聲聞的問題如《觀經疏》以及《淨土十疑論》合起來領會。現今闡明大乘又有三種。
一是三乘通教。這一教門雖然通大，類同二乘。又當教菩薩，雖然教化其他淨佛國土，教化後，還同二乘歸向永滅。淨土深理，不是他們知道的。不是了義啊。
二是大乘別教。這是指大乘「獨菩薩法」。雖然談實理，「道後」才證，因果不融。而淨土在理外修成，萬法卻不由心具。雖然塵劫修道，廣游佛剎，對於那淨土因果，只是「體外方便」。這也是不了義。
三是佛乘圓教。這一教門的要旨圓融，因果頓然具足。佛法的妙，在這之前，不知所以啊。經上說：「十方諦求，更無餘乘，唯一佛乘。」就是這個意思吧。所以是大乘中的大乘，了義中的了義。
十方淨土穢土，同時包含在剎那間。一念色心動起，羅列遍布在法界中。都是天然本有，不是緣起新成。一念既然如此，一塵也是這樣。所以能夠每一塵中一切剎，每一心中一切心。每一心塵又互相周遍，重重無盡沒有障礙。一時頓現不是隱與顯，一切圓成沒有勝與劣。如神珠的頓時含照眾寶，如帝網的千光交相輝映。我心也一樣，眾生與佛本體等同。如此卻是剛剛回神的億萬剎土，實際是自己心中生出。孕育的九品蓮花，哪裡逃出剎那的範圍?如果事與理遠隔，淨土穢土互相妨礙，怎麼能使五逆凡夫，十念就登上寶土，二乘賢輩，回心就到達金池呢?相信這圓談，那事就沒有不通達。蒙昧這個至理，那處處就都迷了。所以《華嚴經》說：「心如工畫師，造種種五陰。一切世間中，無不從心造。」(造通二種。一是理具名造。十界的依報正報，一念就具足。二是變起名造。全理的緣起，知無不為。)如心與佛也是如此，如佛與眾生一樣。心佛以及眾生，這三方面沒有差別(實在因為三無差別，才能感應道交，悲願相攝。共變各變，因果才成。如果只知一理無差，不曉得諸法互相具有，那還沒有很好的圓融意旨。)。又《大乘起信論》說：「所言法者，謂眾生心。」(直指凡心)這心當下含攝一切世間(六凡法界)出世間法(四聖法界。攝的意義也有二種。一是理具。二是事造。包括十界。十界之內，身土淨穢，什麼法不在)。依據這個心，顯示摩訶衍的意義(摩訶衍，就是大乘。如果不是這個心，怎麼能乘運)。《十六觀經》說：「諸佛如來，是法界身。入一切眾生心想中。乃至是心作佛，是心是佛。」(諸佛就是法界身，在一切眾生心想中，以及這心可以作佛，這心就是佛)又《般舟三昧經》說「佛是我心。是我心見佛，是我心作佛」等。談這個旨意的，在大乘經卷中，璀璨繽紛隨處可以舉出。至於《法華》妙經，如來親自授記往生。《華嚴》奇談，普賢親自陳述回向。所以知道彌陀在因地時，觀到這個理而發大誓願普收眾生。釋迦的果成熟，稱讚這個理而出廣長舌深深讚嘆。十方三世，莫不是一樣。
問：如上面的說明，妙理圓融極了。那麼世人都須要觀行，才能往生嗎?
答：這不是啊。現今只是決斷疑情，使人知道淨土的百寶莊嚴，九品因果，以及在眾生一念微細的心中，理性具足，才能知道今天往生的套用，隨願自然。雖然遍及十方，也不離當前一念。往來法界，正在唯心中，避免庸常的見解，執這個否定那個。那行願的相，正在次門，不是這裡問的。何況九品往生的相狀，各有行類不同。上輩三品，須要解須要行。所以經文說：「汝行大乘，解第一義。」就是那樣的人了。如果今天的學人，見賢思齊，企望金座而高升，唯有妙觀可以依託。如果是那中下等的，六品往生的因，只是精進持戒，在世間行仁慈。至於下下品的往生，本來是惡逆人，十念精誠，便生到極樂國。只要能知道有淨土，都可以回心嚮往。如果不是這樣，哪有九品的差別啊。(世人縱然說淨土出自大乘教，不能如上面針對教理去分辯，難免混濫，不值得決疑。)
三是疑自
提問說，我是博地凡夫，世間煩惱多。為什麼這個身往生到淨土，進入賢聖海，同正定聚(必定正悟)一樣呢?
解釋說，如果了悟如上法性虛通，以及相信彌陀本願的攝受，只是勤修功福，哪裡還用問?何況十念的就能往生，唯有除了五逆罪以及誹謗正法。再說定心十念，五逆誹謗的也能往生，如今幸好沒這個惡，而且真正信願專志求生，還有什麼疑惑呢?