普賢菩薩對善財童子說：「所謂懺悔業障就是，菩薩自己思維，『我從過去無量劫以來，由於貪心、嗔恨心、愚痴心深重，迷失了自己的本性，產生了身業、語業、意業，所做的種種惡業無量無邊。假如惡業有形體相，就是遍滿虛空也容納不了。
我現今以完全清淨的三業：清淨的身業、口業、意業，在法界極微塵數那麼多的剎土，一切諸佛菩薩面前，誠心誠意地懺悔自己第罪業，以後再也不造此罪業。』
業分有漏業、無漏業，或者善業、惡業、無記業。佛經告訴我們，惡就是違背真理，違背正見。違背正見的思維就是邪心，就是邪見。還有引業和滿業。我們因為沒有學佛大之前作各種惡業導致痛苦不堪，所以佛菩薩用各種方法，來清淨我們的業障。
一般來說，懺悔業障可以有以下幾種方法：
即擇地建壇，選擇一個適當的地方建立法壇，請戒德師依律作法。比如我們求法求受戒律，一般都是寺院，要有戒師，有儀軌師，如理如法，懺悔時自陳所造罪業毫不覆蔽，全部發露。由此嚴持戒體，則戒體益，如犯戒則戒體破壞，所以懺悔後不能犯戒造業。
所謂取相懺悔就是在佛菩薩像前懺，在佛菩薩像前誠心禮拜，發露過錯，懺悔所犯罪業，一日至七日，二七日，三七日甚至一年，兩年，三年，必期親見光華瑞相而諸最消滅。
即拜佛的名號，佛的早晚課誦中，八十八佛即大懺悔文。《三千佛名經》即千佛懺，還有萬佛懺。誠心拜懺就能消除煩惱罪業。
《大寶積經》：「一切眾生犯五逆十惡乃至萬劫不能懺悔者，稱三十五佛聖號，虔誠禮拜，一切罪業皆消除。」再加上《觀藥王藥上二菩薩經》的五十三位佛，共八十八佛名號。由諸佛的洪名有如明燈能除黑暗煩惱，能消除一切罪業，有不可思議之殊勝功德，故寺院僧人都財八十八佛，這是必修課。
我們剛開始從事上懺悔，只要誠心拜懺，就能以禮拜儀法，來統一我們的精神，攝持我們的意念，摒除雜念，清除我們過去的罪障，獲得身心清淨。