在修學的過程中，宗喀巴大師告誡我們，皈依三寶不能僅僅停留在口頭上，更要落實到行為和心態上。佛法就是信願行，信貫穿整個修行過程。我們只有對皈依三寶的因奠定下堅信的基礎，才能跟《廣論》相應。
真正的皈依不是指形式上和表面上的皈依。如領個「皈依證」或口口聲聲不離「三寶」。真正皈依是必須出於主動，一心一意地依靠、信賴、服從上師三寶。如米拉日巴到瑪爾巴大師那裡學真法時，大師就不收他，說佛門不要你這樣的劊子手。說他罪孽深重，不讓他修法，他硬要求修法。別的弟子聽法時，師父便打發他去幹活，背石頭、背土，白天黑夜都勞動。但他不灰心，以洗罪、懺悔的心去勞動，消罪十二年，師父這才給他傳了真法。又修了十八年，吃的是草，他的膚色都變成了綠色，這樣才修成。現在的人下不了這樣的決心，所以也得不到那樣大的成就。