緣起咒是一切善逝的法身，誰見緣起即見善逝。哪怕是將它放在油柑子大的小塔當中，今生中也能生起梵天福德。持誦一遍此咒能清淨一切罪業，平息，遣除一切違緣。如果觀想任何事物而誦，相當於造佛像或佛塔。若觀想任何供品而誦，則等於供養遍滿世間界的供品。如果恆時念誦，則圓滿一切心愿，任何損害也不能侵害，完整受持一切正法。如果誦十萬遍，那麼將如願實現一切所求之事。在它的各種事業儀軌中也有宣說。大圓滿系解脫咒中說這也是能獲得化生安住相續解脫的心咒。總之，一切如來得手印，猶如諸法的生命一般，功德不可思議。這是全知麥彭仁波切著的淨除業障百咒功德中宣說的。願一切善妙吉祥!
緣起咒可以清淨不好的緣起。一切都是緣起。如果念誦經文、儀軌、咒語時，有不好的緣起，就不會有成就和效果。念誦緣起咒後，所有不好的緣起都能消盡，一切都會吉祥、圓滿。緣起咒的內容也包含了所有佛法的內容，功德特別大。
在觀修金剛薩垛的時候，很多人一定會有許多不清淨、不吉祥、不如法、不圓滿的想法和行為，只要誠心誠意地誦持緣起咒，就能把這些不好的緣起改變過來。我們在平時觀想誦咒的時候，也會有很多不好的念頭，這樣不但沒有功德，還會對修行造成障礙，所以無論做什麼有個好的緣起特別重要。念誦緣起咒，就可以把那些不清淨、不好的念頭、想法都變成好的緣起，只有好的緣起才能使我們的修行達到究竟的圓滿。
無始以來的深重罪業，都是以自私而造，從今天開始改變自心，一切都要利他，這樣才能破「我執」而消罪業。不要只想自己個人懺罪，要想這個世界的無量眾生，罪業都異常深重，如果罪業有體相，盡虛空都無法容納，而三惡趣眾生的罪業更是深重的無法形容。
所以，要發大心，代一切眾生消業、為整個世界消業，而虔誦金剛薩埵心咒。
大乘的修行，不是為自己一個人修，永遠都是和一切眾生一起修，每次修，都要心中觀照一切眾生。這樣修，和不發菩提心只為自己修，功德相差很遠，其差距不可以道里計。