藥師佛修法儀軌
一、儀軌步驟如下：
1.爐香贊(一遍)
爐香乍爇，法界蒙熏，
諸佛海會悉遙聞，隨處結祥雲，
誠意方殷，諸佛現全身。
南無香雲蓋菩薩摩訶薩。(合掌)
南無香雲蓋菩薩摩訶薩。(合掌)
南無香雲蓋菩薩摩訶薩。(合掌)
2.淨口業真言(三遍以上)
ōng，xiū lì xiū lì，mó hē xiū lì，xiū xiū lì，sà pó hē。
唵，修利修利，摩訶修利，修修利，薩婆訶。
3.淨身業真言(三遍)
ōng，xiū duō lì，xiū duō lì，xiū mó lì，xiū mó lì，suō pó hē。
唵，修多唎，修多唎，修摩唎，修摩唎，娑婆訶。
4.淨意業真言(三遍)
ōng，wá rì là dá hē hè hōng。
唵，嚩日囉怛訶賀斛。
5.淨三業真言(三遍)
ōng，suō wá，pó wá shú tuó，suō wá dá mó suō wá，pó wá shú duó hàn。
唵，娑嚩，婆嚩秫馱，娑嚩達摩娑嚩，婆嚩秫度憾。
6.安土地真言(三遍)
ná mó sān mān duō mú tuó nán ōng dù lu dù lu dì weǐ suō pó hē
南無三滿哆，母馱喃，唵，度嚕度嚕，地尾薩婆訶
7.虛空藏菩薩普供養真言(三遍)
ōng，é é nǎng，sān pó wá，fá zǐ là hōng。
唵，誐誐曩，三婆嚩，伐日囉斛。
8.藥師贊(一)
十二大願，饒益有情，
密咒加持德難名，禮念願圓成，
怨業冰清，壽永福慧宏。
9.藥師贊(二)
藥師佛延壽王，光臨水月壇場，
悲心救苦降吉祥，免難消災障，
懺悔眾等三世罪，願祈福壽綿長，
吉星高照沐恩光，如意保全康。
10.藥師偈
藥師如來琉璃光，焰網莊嚴無等倫，
無邊行願利有情，各遂所求皆不退。
南無東方淨琉璃世界消災延壽藥師佛
南無消災延壽藥師佛(數百千聲)
南無日光遍照菩薩(三稱)
南無月光遍照菩薩(三稱)
11.藥師灌頂真言
na mo po qie fa di bi sha she ju lu
南無 薄 伽 伐 帝， 鞞 殺 社，窶 嚕
bi liu li bo lai po he nai she ye tan ta
薜 琉 璃，缽 喇 婆，喝 囉 闍 也，怛 他
jie duo ye a nai he di san miao san bo tuo ye
揭 多 耶，阿 囉 訶 諦，三 藐 三 勃 陀 耶
tan zhi ta an bi sha shi bi sha shi
怛 姪 他，唵，鞞 殺 逝，鞞 殺 逝，
bi sha she san mo jie di suo ho
鞞 殺 社， 三 沒 揭 諦，莎 訶
(註：若見男子、女人，有病苦者，應當一心為彼病人，常清淨澡漱，或食或藥，或無蟲水，咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅。若有所求，至心念誦，皆得如是，無病延年。命終之後，生彼世界，
得不退轉，乃至菩提。)
12.藥師心咒
die ya ta ong bei kan ze bei kan ze ma ha
喋 雅 他 嗡，貝 堪 則 貝 堪 則，瑪 哈
bei kan ze la za sa mu ga die so ha
貝 堪 則，喇雜 薩 目，嘎 喋 梭 哈。
(註：若見男子、女人，有病苦者，應當一心為彼病人，常清淨澡漱，或食或藥，或無蟲水，咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅。若有所求，至心念誦，皆得如是，無病延年。命終之後，生彼世界，
得不退轉，乃至菩提。)
13.解冤咒
解結解結解冤結，解了多生冤和業，
洗心滌慮發虔誠，今對佛前求解結。
藥師佛，藥師佛，消災延壽藥師佛，隨心滿願藥師佛。
14.七佛通偈
諸惡莫做，眾善奉行，
自淨其意，是諸佛教。
15.回向偈
佛光注照，本命元辰，
災星退度福星臨，九耀保長生。
運限和平，福壽永康寧。
願消三障諸煩惱，願得智慧真明了，
普願罪障悉消除，世世常行菩薩道。
二、儀軌注意事項：
修行人不管修習任何法門、儀軌必須嚴守戒律，諸惡莫做，眾善奉行。本儀軌適合每一個人，如能堅持修習本儀軌可得無量無邊的功德與福報，更能滅除無始以來的各種罪業。長期修習藥師法門功德殊勝，修習者的相貌將變得越來越莊嚴、圓滿。修習本儀軌注意如下：
1.身、口、意業須清淨。最基本應做到不殺生、不吃肉、不邪淫、不打妄語;
2.本儀軌從上到下依次念誦，每天最少1遍，念誦越多消罪越大，福報越多;
3.讀誦時以敬、誠為上。如：吃東西須漱口、洗手後才能念誦;
4.如果無法做到茹素念誦，念誦須淨口，念誦至少3遍以上淨口業真言，修習本儀軌1遍、21遍、36遍、49遍、108遍等為宜;
5.注音註解：唵：讀(ōng嗡)或讀(ǎn俺)。(ōng嗡)，是藏語系佛教的讀法，漢字無此音，一般注近似音讀作(wēng嗡)。漢語系佛教讀(ǎn俺)。
斛：讀音為(hōng轟)同「吽」，也有的地區讀本音(hú胡)。
嚩：讀(wá娃)。經考究：《密宗秘法》讀(wá娃)，也有的人讀(wā蛙)。一般，「薩嚩訶」「莎嚩訶」等類似譯音詞中，我們才讀作(pó婆)。馱：讀音為(tuó陀)。婆嚩秫度憾：秫讀作(shú熟);度：讀作古音(duó奪);憾：讀音(hàn漢)。以上有兩個發音字型可選自己喜歡的發音，不用執著;
6.淨業真言中，可以只選擇其中的一個或幾個來讀，依照個人情況酌情來定。如果自己覺得口業重，則可多讀誦淨口業真言，身業重可多誦淨身業真言，或者唯讀誦淨三業真言亦無不可。一般在誦經念咒前誦讀七遍淨業真言，以示敬重。