中觀密護淨土，很關鍵的一點是交代了淨土和煩惱之間的關係。不僅說心實有淨土就實有，環境實有淨土就實有，還談到了最關鍵的節骨眼上，就是煩惱到真如之間的距離，濁世到淨土之間的距離。
如果想了解自己什麼時候能夠開悟，什麼時候能夠見到阿彌陀佛，那就以現前環境的實有程度為依據。它如果很實有，淨土就難以現前，如果是如幻如化，淨土剎那之間就現前。所以五濁惡世到淨土之間的距離，就是我們的煩惱到真如之間的距離。如果知道煩惱到真如之間的距離已經不遠了，必定會有可以驗證的，即能夠看到現前的濁亂世間到淨土之間的距離。這又是至關重要的關係。
我們已經了解心實有，外境實有，淨土就是實有的，已經確定了相對待的存在和相對待的空性。在存在的、實有的狀態下，還需要算一算濁世到淨土之間的距離和時間，煩惱到真如之間的距離和時間。煩惱到真如的距離=濁世到淨土的距離，這是一個等式。煩惱離真如越近，五濁惡世就離淨土越近。
這個等式能幫我們確定什麼?能確定如果要到淨土去，煩惱對我們的意義是什麼。煩惱的作用是障礙我們到達真如本性。煩惱不能放下，我們就離空性甚遠;對濁世的執著不能放下，就離淨土甚遠。如果懂得放下煩惱，那麼離真如本性就會更近。當離心的本性更近時，五濁惡世離淨土自然就更近了。
所以淨土的修行至少有兩種模式。第一種模式是發願念佛和求生淨土，第二種模式是放下貪嗔痴，放下煩惱，靠近真如本性。這兩種模式在同步進行著。
從這個意義上說，禪門事實上也是最好的淨土法門。因為禪門的修行就是來放下煩惱、靠近真如本性的。因為當煩惱放下，靠近真如本性的時候，五濁惡世自然就靠近淨土了。
《維摩詰經》云：隨其心淨則國土淨。如果是心清淨，國土就清淨，心清淨到什麼程度，淨土就呈現到什麼程度。所以，很多人攻擊淨土宗不如法，但事實上宗派之間無法割裂，你沒有辦法說這是斷煩惱的修行宗派，那是念佛求淨土的宗派。事實上都是一個宗派，因為煩惱心到真如本性之間的距離就是五濁惡世到淨土之間的距離。
這是至關重要的聯繫，假如把這種聯繫切斷，單純地從五濁惡世去求生淨土，而忽略煩惱的問題，甚至縱容煩惱，那就使得心到真如之間的距離越來越遠。最終會導致一個結果，就是五濁惡世到淨土之間的距離越來越遠，淨土就越來越渺茫。
濁世到淨土的距離跟煩惱到真如本性之間的距離，看起來或許是兩件事，或者說修行起來是兩個宗派，但事實上對於我們的心來說，它們是同一回事。