上師瑜伽是大圓滿里開悟見性的一個方法。修上師瑜伽，要將上師視為佛，並強調將上師視為法身佛。其實其他密法里也有視上師為佛的要求，但是主要為色身佛。比如上師為觀音菩薩，本尊和上師融為一體。阿底瑜伽大圓滿里，將上師視為佛，是要將上師視為法身佛。
法身佛指什麼?就是指自己的自性，一轉念你就見性了。還有通過上師身口意灌頂加持，消除自己身口意的業障，最後上師化成光融入自己，自己和上師融為一體。這個時候上師是法身佛。法身和法身融為一體，就是上師的自性和自己的自性融為一體。
萬法一性，一個自性，這也是一種引導。上師化成光融入自己，或自己化成光融入上師，猶如水融入水。這就是見性、回歸自性的意思。很多人都沒有明白，為什麼要將上師要視為佛?上師怎麼能化成光呢?怎麼能融入我呢?滿腦子都是疑惑。這樣的人不是法器，他根本得不到這個法。你明白的話，上師就是法身佛。法身佛是什麼?法身佛指的是自性，上師也是自己的自性，本來就是一體的。見性了，明白了，就是上師瑜伽。
但是現在很多人都知道上師瑜伽好，但是不知道上師瑜伽的真實意義。上師瑜伽好，將上師觀在前上方，執著這個色身，最後跟這個色身融為一體，這是不可能的事。上師瑜伽的要求就是要將上師視為法身佛。阿底瑜伽大圓滿中，一切竅訣都在上師瑜伽里。上師的三輪有三種字發光，都是你的意念，你要這樣觀想。同時融入自己的三門，消除了自己通過身口意三門造的業，然後自己得到寶瓶灌頂、秘密灌頂、智慧灌頂、句義灌頂等等四灌頂，這也是相續成熟的一個過程。
一切都是靠憶念，靠堅定的信念。最後自己得到四種灌頂了，相續已經成熟了。然後上師化成光融入自己的體內，或者自己化成光融入上師的體內，好比水融入水一樣。本來就是一個自性，本來就是一體的。上師融入你的心間，你融入上師的心間，這都是回歸自性的意思而已。
阿底瑜伽大圓滿里，主要是修上師瑜伽，靠上師加持、竅訣。當弟子的相續成熟的時候，師徒就很容易溝通了。