我們發願，要讓眾生離苦得樂，但畢竟還是凡夫，還沒有能力真正代眾生受苦，所以練習願菩提心時，在自他平等的基礎上，進一步觀修自他交換，配合呼吸來替眾生受苦。
關於自他平等和自他交換的標準，巴祖仁波切比喻說：自他平等，就是如果只有一條氈子，是我和他人一起蓋。而到了修自他交換時，就要把氈子給其餘所有人蓋，自己排除在外。或是在大雪過後，自己穿著一雙鞋，有個人光腳，我就脫下一隻鞋給他。於是，我和他一隻腳都沒有鞋穿，同樣感受寒冷之苦;而我和他的另一隻腳都有鞋穿，同樣避免了寒冷之苦。而修自他交換時，則應該是把兩隻鞋都送給別人，完全不考慮自己，他的一切痛苦由我承擔，我的一切快樂都給他。也就是說，在修行「有福同享、有難同當」時，如果有什麼過失災難，主要由自己來承擔，以自他交換來去除我執。
我們可以用呼吸法，觀修自他交換。可以先從今世的母親開始，修自他交換。我們先把今世的母親觀想在前面，一樣先從知母、念恩、報恩開始觀修。觀修後，生起了強烈的報恩之心，接著，心裡思維：母親這一世要受生老病死的痛苦，後面等待的，是中陰和來世的痛苦，還有貪嗔痴煩惱和十不善的痛苦。過去世，母親為我承擔起所有的虧損失敗，而把一切利益勝利奉獻給我。現在，輪到作為孩子的我，為母親遣除痛苦，生起大悲心來代受。
祈願我現在微小的快樂，直到暫時的人天安樂和究竟佛果之間的一切樂果，以及具足信心、出離心、菩提心這些樂因，當下快速成熟在母親身上。如果她具足這些樂因那該多好;我一定要使她具足安樂之因;為了使她具足樂因，虔誠祈禱三寶。
同時願母親的苦因及苦果，在當下成熟於我的身心。如果能成熟於我身那該多好;我一定要使她的苦因及苦果成熟於我身;為了做到這一點，虔誠祈禱上師三寶，願以大悲威德力關照我。然後配合呼吸來觀修：
1.吸氣時：母親的苦因及苦果，以黑氣的形象，從自己的鼻孔吸進體內，如此一來，我就具有了苦因及苦果，母親離開了苦因及苦果。心裡要想：母親的痛苦我要承受，我在行為上，要努力遣除母親的痛苦。反反覆覆加以思維。
2.呼氣時：我的身體受用、幸福快樂的一切事物，以白氣的形象向外排出，離開了樂因及樂果，同時母親一併向內吸氣，擁有了樂因及樂果。心裡要想：為了母親得到樂因及樂果，我在行為上，必須從細微的快樂開始去做。然後，再擴展到自己的父親、兄弟姊妹等，慢慢依次對四周的人觀修，最後遍及一切眾生。最後，以四個要件發願祈禱：
1.發願：願一切眾生，遠離苦果及苦因，具足從人天果報直到佛果之間的樂果，以及信心、出離心、菩提心等樂因。
2.希求：如果他們能夠遠離苦果及苦因，具足樂因及樂果，那該多好。
3.發誓：我一定要使他們遠離苦果及苦因，具足樂因及樂果，從今天起，這個責任由我來承擔。
4.祈禱：虔誠祈禱三寶，讓我能圓滿上面的願望。
然後，在這樣感受中不起念頭，在無緣狀態中盡力安住。
另一種方式，直接觀想前面有一個被苦難逼迫的眾生，和上面一樣祈願：
1.呼氣時：觀想自己所有的快樂、美貌、健康、財富、智慧、功德種種福報，以白氣的形象從鼻孔排出，像脫下外衣送給別人一樣，全部送給那些受苦受難的眾生，由此他們具足了樂果及樂因。
2.吸氣時：觀想他們的病痛、災難和煩惱，以黑氣的形象從自己的鼻孔吸入，由此他們脫離了痛苦，所有的不幸都由自己來承受。
最後，一樣以發願、希求、發誓、祈禱等四要件祈禱，最後盡力安住在無緣狀態。我們要以觀察修和安住修交替，同時祈禱上師，一再反覆觀修。
人生不可能永遠快樂或痛苦，一定是苦樂交替出現，但不管享樂或受苦，都要以菩提心攝持，同時用呼吸法，觀修自他交換。當我們生起信心、出離心、菩提心等快樂的因時，不可以心生傲慢或執著不放，為了讓它永不失毀，就要提前布施給眾生。觀想我的一切快樂等人天福報，直到成佛之間的樂果，以及信心、出離心、菩提心等樂因，配合呼氣，全部送給眾生，希望他們完全脫離苦難，得到快樂幸福。
而當處於疾病等痛苦，或不幸接續而來時，也要像修皈依時一樣，知道這些痛苦是三寶的大悲加持，心裡想：但願以我一人的這種災難，替代天下一切眾生的所有痛苦。
當自己生起貪心、嗔心等苦因時，也要想到，這是三寶以大悲警告暗示我，自己還有要捨棄的煩惱，但願以我這樣的煩惱，承擔一切眾生的貪慾等煩惱，讓眾生的所有煩惱和業果，都成熟在我的身心相續。
例如，頭痛等身體不舒服時，想想三界六道的眾生中，一定有很多眾生現在所受的苦，和我現在的痛苦一樣，甚至比我還要苦。但願一切眾生的所有痛苦，都由我承受，依靠我的這次頭痛，代替一切眾生的所有痛苦。但願以我的疾病，替代眾生的疾病;但願以我的疼痛，替代眾生的疼痛;但願以我的不順遂，替代一切眾生的不順遂;但願以我的煩惱，替代眾生的煩惱;但願以我的死亡，替代眾生的死亡。
進一步觀想，自己不論處於輪迴中的哪一道，不論受到什麼痛苦，遭受生病、失敗、損失等任何的不幸和苦難，都能承受，並發心希望所有眾生的痛苦業報，都成熟在自己身上。而自己所擁有的安樂和福德，希望眾生都能具足。以這樣的觀想，配合呼吸，反反覆覆加以思維。
這樣一來，自己不管生起了苦因，還是承受了苦果，都能轉為道用，成為修道上的助伴，進而清淨無數劫的罪惡，讓資糧得以圓滿。
有些人擔心修自他交換時，別人的病痛和災難，會轉移到自己身上。其實，這只是心理作用。有時修自他交換，身體某些地方好像會疼痛，似乎別人的病跑到自己身上，其實不會的。有一天，當你成就佛菩薩的果位，有能力幻化千百萬，乃至無量身的時候，真實的自他交換是有可能的，但在沒有成就之前，都是在觀修的範圍內。
自他交換，就是一般人說的換位思考，是大乘修行人應該學習的精要法門。《入菩薩行論》中說：「若不以自樂，真實換他苦，非僅不成佛，生死亦無樂。」意思是，如果不能以自身的安樂，真實替換他眾的痛苦，則不但不能成就佛果，即使在生死輪迴中，也不會有快樂可言。因為修菩提心，目的就是要斷除我執。在心裡生起一次自他交換法，多劫的罪業自然就能消除，快速得到廣大的福慧資糧。
釋迦牟尼佛在過去世還是凡夫時，曾經轉生到地獄。獄卒要他和同伴嘎馬日巴一起拖一輛非常龐大的馬車。他們兩人拖不動，就被獄卒用熾熱的兵器不斷捶打，非常痛苦。
當時的佛陀就想：「我們拖不動就會被打，與其兩個人受苦，不如所有的苦都由我來承擔。」於是，他問獄卒說：「可不可以將套在嘎馬日巴身上的繩子，套在我身上，讓我一個人來拖車?」獄卒一聽，認為各自造業，只有各自承受，誰能違反這個定律呢?就馬上拿起鐵錘，往他頭上用力一打，當下他就被打死了。但因為他發了善心，想代同伴受苦，以這樣自他交換的簡單念頭，使他福報現前，死後馬上到三十三天界。
我們知道，地獄眾生是想死也死不了，不論被殺了多少次，都會死而復生，不斷重複受苦，直到業力耗盡。所以，在地獄中能夠死而轉生，其實是一種解脫。這是釋迦牟尼佛首次利他的開端，發現以「自他交換」利益他人，反而可以利益自己，迅速得到成就。
自他交換是修行過程中不可缺少的。過去噶當派的格西們，就是以自他交換為修行核心。朗日塘巴尊者在《修心八頌》說：「虧損失敗自取受，利益勝利奉獻他。」這種菩提心，以大悲心取受虧損失敗，是以悲心緣眾生;而以大慈心給予快樂勝利，是以智慧緣正等菩提。概括來說，交換的內容，可以歸納四個方面：
1.執著交換：把原本執著的「小我」，擴大為把一切眾生執著為「我」，三善趣是自己身體的上半身，三惡趣是身體的下半身。或者，一切眾生是我的母親，我作為孩子，把眾生執為「我所」。
2.愛重交換：放下以往貪愛重視自己的心態，轉而珍視一切眾生。
3.苦樂交換：以前，是快樂留給自己，痛苦留給其他眾生。但現在反轉過來，凡是幸福快樂的事，都給予其他眾生，其他眾生的所有痛苦由我來承受，並結合呼吸等觀修法。
4.自他交換：原本無我，卻執著為我。今世的身心，是前世的意識進入到父母精血因緣的和合，而將身體執為我。這種我執，從無始以來就一直串習。有了我執，就會追求世間八法，所以將利益勝利都歸於自己，虧損失敗都給予其他眾生，讓我們漂泊至今。
所以，我們不能再自私自利下去，一定要好好思考利益眾生的功德，以及貪執自己的過患，要設身處地為他人著想，進而做到「虧損失敗自取受，利益勝利奉獻他」。如此一來，在擁有樂因和樂果時，以大慈心施捨眾生;在遇到苦因及苦果時，不但不會成為違緣，反而以大悲心取受，可以清淨業力，根除貪執自身的惡習。這是從痛苦中解脫最好的方法，事實上，最後受益的還是自己。
所以，我們身體有疾病、心中有煩惱時，發願以自己的苦，承擔所有眾生的苦，不但不會增加痛苦，反而能讓病痛和煩惱很快止息，心裡得到安寧，身體很快復原。甚至，如果遇到妖魔鬼怪種種的傷害，也沒有比作自他交換的菩提心更殊勝的，可以馬上有效脫離魔障，得到解脫，讓修行達到更高的成就。而且，依靠所有眾生的恩德，生生世世能獲得具足十八暇滿的人身，究竟能證得圓滿佛果。