臨床經驗證實，常吃黑木耳對各種異物造成的胃腸不適和體內結石的特殊輔助療效。
黑木耳對無意食下的難以消化的頭髮、穀殼、木渣、沙子、金屬屑等異物具有溶解與烊化作用。為防止和治療各種異物造成的胃腸不適或病症，不妨常吃些黑木耳，尤其是從事理髮、開礦、粉塵、鋸木、修理、護路等作業的人員更應經常食用。
黑木耳對膽結石、腎結石、膀胱結石、糞石等內源性異物也有比較顯著的化解功能。
黑木耳之所以具有這些神奇的功能，一方面是因為它所含的發酵素和植物鹼，具有促進消化道與泌尿道各種腺體分泌的特性，並協同這些分泌物催化結石，滑潤管道，使結石排出。另一方面則是黑木耳還含有多種礦物質，能對各種結石產生強烈的化學反應，剝脫、分化、侵蝕結石，使結石縮小，排出。
食用黑木耳化解結石的方法是，對於初髮結石，保持每天吃適量的黑木耳，疼痛、惡嘔等症狀可在2—4天內緩解，結石能在10天左右消失。對於較大較堅固的結石，其效果相對要差一些，但如經常食用黑木耳，亦可使有些人的結石逐漸變小變碎，排出體外。
需要強調的是，黑木耳溶解異物和化解結石只能起到預防和輔助作用。如果異物太大、太多或結石大而堅固給患者帶來了痛苦，就一定要及時就醫，以免耽誤病情。
此外，常吃黑木耳，還能預防血栓等症的發生。