眾所周知，吸菸有害於健康。吸菸最常見的疾病是肺癌、支氣管炎、肺氣腫、肺心病、缺血性心臟病和其它血管疾病、胃和十二指腸潰瘍。吸菸者的死亡率高於不吸菸者。肺癌死亡人數的90%為吸菸者，吸菸量越多，肺癌死亡率越高。胃和十二指腸潰瘍患病率，吸菸者為不吸菸者的兩倍。
青少年正處在生長發育的突增時期，身體的各種組織和器官尚待發育和完善，精神系統、內分泌功能、免疫功能都不穩定，對外界有害物質的抵抗力、適應力都很差，很容易罹患多種疾病。香菸燃燒時，煙霧中的多種有害物質(尼古丁、煙焦油、3，4苯並皮、一氧化碳等)，對青少年機體的損害更為嚴重，吸菸年齡越小，損害越大，不僅易患感冒、支氣管炎、肺炎，還可患與成年人一樣的肺氣腫、肺心病、慢性支氣管炎和支氣管擴張等疾病。青少年吸菸除了易患各種與煙有關的疾病外，還會影響機體和智力的發育。體檢表明，吸菸學生的身高、胸圍、肺活量都比不吸菸的同年齡學生低。據長期觀察證實，吸菸學生的靈活性、耐力、運動成績、學習成績和組織紀律性都比不不吸菸的學生差。吸菸對於中樞神經系統與大腦的學習和記憶能力所產生的影響，近年來已受到人們的重視。
另外，「被動吸菸(指不吸菸者被動吸入吸菸者突出的煙霧)」的危害也已引起全世界醫學專家的重視。值得注意的另一個問題是，很多吸毒者大多是從吸菸開始的。所以，青少年不僅自己不要吸菸，還應勸誡其它人。
抽菸是一種不健康的生活習慣，抽菸對人體的危害有：
【腦部】
吸菸會引致多種腦部疾病，會減低循環腦部之氧氣及血液，引致腦部血管出血及閉塞，而導致痳痺、智力衰退及中風。中風原因是吸菸導致腦部血管痙攣，使血液比較容易凝結。吸菸者中風機率較非吸菸人士高出兩倍。
【喉部】
吸菸可導致喉癌。喉癌患者以男性居多。
【心臟及血管】
吸菸會使脂肪積聚、血管閉塞，令吸菸者容易患冠狀動脈心臟病。因吸菸而導致的心臟病死亡率占全部的25%。50歲以上吸菸人士的患病率提高2倍。50歲以下吸菸人士的患病率提高9至14倍。吸菸令血管收縮，減慢血液及氧份循環，最終導致血管壁變厚，誘發冠心病及中風。吸菸會令手腳血液流通完全受阻，以致截肢。
【肺部】
吸菸會引致肺癌。90%的總死亡率是由吸菸所導致。一個人每天吸食十支煙，其患病率是非吸菸人士之十倍。被破壞的細胞不能回復正常。初期病徵不會被察覺，直至癌性細胞漫延至血管及其他器官。吸菸亦會引致肺氣腫，肺部支氣管內積聚之有毒物質，會阻礙人體吸入之空氣正常呼出，令肺部細胞膨脹或爆裂，導致患病者呼吸困難。
【胃部】
患有腸胃性疾病者，吸菸足以使腸胃病更惡化。患有胃潰瘍或十二指腸潰瘍者，潰瘍處的癒合會減慢，甚至演變為慢性病。吸菸能刺激神經系統，加速唾液及胃液的分泌，使胃腸時常出現緊張狀態，導致吸菸者食欲不振。另外，尼古丁會使胃腸黏膜的血管收縮，亦令食慾減退。
【骨骼】
吸菸人士的斷骨康復期要比不吸菸人士長。可能是煙所含的尼古丁及一氧化碳拖緩了骨胳的再生的進度。尼古丁令血管收縮，降低了流到新生骨骼的血量。吸菸時吸入的一氧化碳，亦同時減少進入身體的氧氣比率。吸菸會引致盤骨炎及背痛。每天抽菸十支以上，將盤骨炎患病率提高一倍。有嚴重背痛的人大部份都有很大菸癮，這是由於吸菸會引致流向關節盤的血液減少，關節盤因而提早退化。吸菸會引致關節炎。每天吸食一包煙，將提高患病率達50%。停經後女性吸菸者更容易患骨折及關節病。吸菸導致骨質流失更快。婦女由青春期至踏入更年期，每日持續吸菸一包，其骨骼比非吸菸者少百分之五至十。當步入更年期後吸菸者的骨質流失率更快。吸菸會干擾雌激素，而雌激素正是骨骼發展的重要荷爾蒙。
【支氣管】
吸菸是導致慢性阻塞氣管疾病的主要發病因素。因為吸菸能引致支氣管上皮細胞的纖毛變短和不規則及其和運動發生障礙，降低局部性抵抗力，容易受到感染。
【肝臟】
吸菸會加重肝臟負擔。經常抽菸會影響肝臟的脂質代謝作用，令血中脂肪增加，使到良性膽固醇減少，惡性膽固醇增加。這個原因令肝臟的解毒功能增加負擔。
【腸】
吸菸會導致結腸癌。患此癌的機會則與吸食菸草的份量成正比。研究顯示停止吸菸雖然可以減低其他疾病例如心臟病、肺癌等的機會，但患上結腸癌的危險就仍然非常大。
【眼部】
吸菸會引起白內障，影響視力。研究顯示每天吸菸超過一包的白內障患者是從不吸菸者的2倍。
【生殖系統】
吸菸對脊髓的神經中樞起抑制作用，使吸菸男人性慾變弱，又由於吸菸能使血管收縮、痙攣，引起末梢血循環障礙。因此，吸菸是導致陽萎的最主要原因。澳洲和加拿大已在香菸盒上直接了當地印上這個信息。另外，吸菸可影響精子的活力，使畸形精子增多，停止吸菸三至六個月後，方可恢復正常。如想要一個聰明、健康的孩子，嬰兒專家提倡一定要停止吸菸三到六個月。
【二手菸】
二手菸是由香菸、菸斗或雪茄燃燒時，飄出來或吸菸者抽菸時呼出的一種混合煙霧。在許多吸菸的場所中，二手菸是最常接觸到的污染物。抽菸時噴出的煙霧可散發超過四千種氣體和粒子物質，大部分這些物質都是很強烈的刺激物，其中至少有四十種在人類或動物身上可引致癌病。在抽菸者停止吸菸後，這些粒子仍能停留在空氣中數小時，可被其他非吸菸人士吸進體內，亦可能和氡氣的衰變產物混合一起，對人體健康造成更大的傷害。
當吸菸危害吸菸者本身健康的同時，二手菸也影響非吸菸者。除了刺激眼、鼻和咽喉外，它也會明顯地增加非吸菸者患上肺癌和心臟疾病的機會。如果兒童與一些吸菸人士同住的話，他們的呼吸系統會較容易受到感染。其他影包括增加咳嗽、氣喘、痰多、損壞肺部功能和減緩肺部發育。