佛珠的種類很多,若就其使用方面來講，通常可分為三種類型：
1、持珠——用手掐捻或者持念的佛珠;
2、佩珠——戴在手腕或臂上的佛珠;
3、掛珠——掛在頸上的佛珠。
持珠，多用來記錄念誦佛號或咒語的數目。在經典中說：若善男子、善女人，有能誦念諸陀羅尼及佛名者，為欲自利及護他人……若欲願生諸佛淨土者，應當依法受持此珠。這就說明，持用佛珠就是藉以約束身心、幫助修行、消除妄念，待日久功深，便能增加智慧，利己護人，同時還會獲得無量的功德。
佩珠，俗稱手串，以十八顆子珠者最為普遍，多以名貴材質或顏色亮麗者為之。時下許多並非信仰佛教的男女，皆以佩帶佛珠為榮，使佛珠儼然成為一種時尚飾品了。在我看來，凡是這些愛戴佛珠的人，皆應看作是深具善根、無始劫來與佛有緣的人。佛陀早有明示：
若復有人手持此菩提珠，不能依法念誦佛名及陀羅尼，但能手持隨身，行住坐臥，所出言說若善若惡，斯由此人以持菩提子故，所得功德如念諸佛、誦咒無異，獲福無量。
掛珠，多採用水晶、瑪瑙、翡翠、珊瑚、密蠟、綠松石等珍貴材料製成，子珠的色澤必須勻淨，要求選用彼此間色彩變化不大、溫潤細膩、光潔晶瑩的好材料製作。同時，子珠的直徑亦要求在一厘米左右，不可有大的誤差。在聯綴時，每二十七顆子珠間嵌入一顆隔珠，在母珠的下方還會配有一種編織精美的「中國結」與美玉、翡翠等掛件組合而成的「佛頭穗」。在重要的法會上或大和尚禮佛拈香的時候，這種「佛頭穗」能夠起到一定的平衡作用，從而保證在整個佛事活動中儀態莊重。一般來講，掛珠的佩戴要考慮一定的季節性，如夏季應選用那些水晶、瑪瑙、翡翠、珊瑚等寶石類，能夠使人有涼爽貼身的感覺;在冬季里就應選用琥珀、密蠟或果實一類的掛珠為好。
此外，尚有一類掛珠是由佛珠衍化而來的，那便是「朝珠」，它是清代官吏特有的一種飾物。朝珠與普通掛珠最大的區別是，朝珠將佛頭穗的樣式改成了由闊絲帶系綴、用銀絲琺瑯裹著、被稱作「背雲」的大墜子，而弟子珠也移到了胸前，由三串組成。因近世有仿製朝珠樣式來充當掛珠者，所以在佩戴朝珠樣式的掛珠時，應當注意以胸前的三顆隔珠為中心對稱，將後背的「背雲」緊靠後背中心，而三串弟子珠是左側一、右側二的形制，切不可亂掛一氣，有悖禮儀。
為了更好地使人了知佛珠的種類，下面介紹一下佛珠各部位的名稱。一串標準的佛珠應該包括母珠、子珠、隔珠(又稱作「數取」)、弟子珠(又稱作「記子」)、記子留和一些飾物組成。
母珠，俗稱「三通」或「佛頭」，通常只有一顆，但亦有兩顆的，用以將不同數目的子珠歸結於一處，同時還可以起到連線弟子珠、記子留和一些飾物的作用。舊時的母珠，多會在內部繪有佛像，採用凸透鏡的原理，可以清晰地觀察到裡面的佛像，更加使人感受到佛珠作為一種法具的莊嚴。
隔珠，又稱作「間隔珠」或「數取」，多用來將子珠平均分隔開。一般來講，隔珠均要比子珠稍大一些，數量可採用一顆至三顆不等。如一百零八顆的佛珠和五十四顆的佛珠，就需要每二十七顆子珠用一隔珠;二十七顆、十八顆的佛珠，則每九顆子珠用一隔珠。
弟子珠的體積比子珠要小一些，一般以十顆或二十顆居多，多串在母珠的另一端，以十顆為一小串，如同算盤一樣，採用十進位，用來計算掐捻過的數目。「十」這個數目代表了佛教的「十波羅蜜」，即：施、戒、忍、精進、禪定、般若、方便、願、力、智。
記子留是指每串弟子珠的末端所附的比弟子珠稍大一些的珠粒或者飾物，也可以用線繩結成「中國結」來替代，目的是為了防止弟子珠的滑落。
每串佛珠都由一定數目的子珠串綴而成，子珠數目隨所據經典不同，表徵不同的含義，茲列表如下：
從上面的表格可以看出，佛珠子珠數目在經典中差異很大，共有九種之多。其實，佛珠有不同的顆數，是因為具有不同的含義，下面就根據普遍流傳的說法，將其不同的含義略述如下：
(一)一百零八顆
是最為常見的數目，為了表示求證百八三昧，斷除一百零八種煩惱，從而使身心能達到一種寂靜的狀態。百八煩惱的內容，有多種不同的說法，總的來說，六根各有苦、樂、舍三受，合為十八種;又六根各有好、惡、平三種，合為十八種，計三十六種，再配以過去、現在、未來三世，合為一百零八種煩惱。如經中所言：諸菩薩問：云何百八?佛言：有所念，不自知心生心滅中有陰有集，不知為痴，轉入意地亦如是，識亦如是，是為意三。見好色、中色、惡色，不自知著不自知滅有陰有集，乃至觸亦如是。彼經但列六根各六，雖無三世之語，而結雲百八，故知是約剎那而為三世也。既以心意識三為意地三，故通三世，如雲集起名心、籌量名意、別知名識。意三既爾，故使所依五根亦爾。三世三個三十六故，故有百八。
(二)一千零八十顆
按天台宗理論，十界無不性具善惡，故一千零八十數目表示十界各有一百零八種煩惱，合成一千零八十種煩惱。「十界」表示整個迷與悟的世界，即：1、地獄界，2、餓鬼界，3、畜生界，4、修羅界，5、人間界，6、天上界，7、聲聞界，8、緣覺界，9、菩薩界，10、佛界。
(三)五十四顆
表示菩薩修行過程中的五十四個位次，其中包括十信、十住、十行、十回向、十地五十階位，再加上四善根位。分述如下：
十信：
1、信心，2、念心，3、精進心，4、慧心，5、定心，6、護法心，7、回向心，8、戒心，9、舍心，10、願心。
十住：
1、初發心住，2、治地住，3、修行住，4、生貴住，5、方便具足住，6、正心住，7、不退住，8、童真住，9、法王子住，10、灌頂住。
十行：
1、歡喜行，2、饒益行，3、無瞋恨行，4、無盡行，5、離痴亂行，6、善現行，7、無著行，8、尊重行，9、善法行，10、真實行。
十回向：
1、救護一切眾生離眾生相回向，2、不壞回向，3、等一切佛回向，4、至一切處回向，5、無盡功德藏回向，6、隨順平等善根回向，7、隨順等觀一切眾生回向，8、如相回向，9、無縛無著解脫回向，10、法界無量回向。
十地：
1、歡喜地，2、離垢地，3、發光地，4、焰慧地，5、難勝地，6、現前地，7、遠行地，8、不動地，9、善慧地，10、法雲地。
四善根：
指見道以前，觀四諦及修行十六行相以達到無漏聖位的四種修行階位，包括：1、暖位，2、頂位，3、忍位，4、世第一法位。
(四)四十二顆
表示菩薩修行過程的四十二階位，即十住、十行、十回向、十地、等覺和妙覺。
等覺：又作等正覺，即指在內容上與佛相等，而實際修行上比佛略遜一籌者。如欲詳細了解，請參閱鳩摩羅什譯《仁王般若波羅蜜經·受持品》。
妙覺：指覺行圓滿之究竟佛果，系由等覺位更斷一品之無明，而得此位。
(五)三十六顆
無確切的含義，通常皆認為是為了便於攜帶，遂三分一百零八顆成三十六顆，其中蘊含有以小見大的義理，故與一百零八顆相同。
(六)二十七顆
表示小乘修行四向四果的二十七賢聖位，即前四向三果的「十八有學」與第四阿羅漢果的「九無學」。
十八有學：1、隨信行，2、隨法行，3、信解，4、見至，5、身證，6、家家，7、一間(一種)，8、預流向，9、預流果，10、一來向，11、一來果，12、不還向，13、不還果，14、中般涅盤，15、生般涅盤，16、有行般涅盤，17、無行般涅盤，18、上流色究竟。
九無學：1、退相，2、守相，3、死相，4、住相，5、可進相，6、不壞相，7、不退相，8、慧解脫相，9、俱解脫相。
(七)二十一顆
表示十地、十波羅蜜、佛果。「十地」見「五十四顆」一段，「十波羅蜜」見「弟子珠」一段的介紹，茲不贅述。而「佛果」指達到最究竟成佛的果位。
(八)十八顆
俗稱「十八子」，此中所謂「十八」指的是「十八界」，即六根、六塵、六識。
六根：1、眼界，2、耳界，3、鼻界，4、舌界，5、身界，6、意界;
六塵：1、色塵，2、聲塵，3、香塵，4、味塵，5、觸塵，6、法塵;
六識：1、眼識，2、耳識，3、鼻識，4、舌識，5、身識，6、意識。
(九)十四顆
表示觀音菩薩與十方、三世、六道等一切眾生同一悲仰，令諸眾生獲得十四種無畏的功德。十四無畏：
1、使眾生返照自性，獲得解脫;2、使眾生旋轉知見，苟遇火難，火不能燒;3、使眾生旋轉觀聽，雖遇大水所漂，水不能溺;4、使眾生入於羅剎鬼國，鬼自滅惡;5、使眾生六根消復，臨當被害，刀段段折壞;6、菩薩明照十方，使眾生不受藥叉、諸幽冥所害;7、使眾生不受虛妄聲塵系縛;8、使眾生行於險路如行坦途，遇賊不受劫;9、使性多淫者，不生色念;10、使懷忿記恨之人不生瞋恚;11、使一切昏鈍無善心之人遠離痴暗;12、使無子眾生，欲求男者，令得生男;13、使無子眾生，欲求女者，即得生女;14、使眾生持觀音名號者，所得福德與恆河沙數無異。
四、異彩紛呈——佛珠的質料
用來製造佛珠的質料，可以說是不勝枚舉，無論是礦物還是植物，大凡竹、木、牙、角均可製成佛珠。但在佛典當中有記載、可用來製造佛珠的質料，卻是非常有限的，最多也不過十餘種，實在無法與現今眾多繁雜的品類相比了。下面將佛經中所舉的佛珠質料加以列表說明。
在佛教中，以「七寶」所製成的佛珠最為殊勝尊貴。七寶的名目，諸經中說法各有不同，《般若經》說有金、銀、琉璃、硨磲、瑪瑙、琥珀、珊瑚七種。佛珠的質料除了上述的「佛教七寶」以外，可用五大類別加以劃分：
(一)菩提類
菩提子，恐怕是最為人們所熟知的一類佛珠了。其實，菩提子並非菩提樹所結的果實，而是指一種產於雪山附近、名字叫川谷的草本植物，其具體相狀是：
春天長苗，莖高三、四尺，葉如黍，開紅白色花，呈穗狀，夏秋之際間結實，圓而色白，有堅殼，如琺瑯質。因多用念佛之數珠，故又稱菩提子。木本者為其別種，我國唯天台山有之，稱為天台菩提。
而現今，「菩提」早已是一個通稱了，代表著「覺悟」的含義。《大唐西域記》云：菩提樹者，即畢缽羅之樹也。昔佛在世，高數百尺，屢經殘伐，尤高四、五丈。佛坐其下成等正覺，因而謂之菩提樹焉。而以菩提來命名的佛珠質料，總計有三十多個品種。這其中有依產地來命名的，如天台菩提、天竺菩提等;有依紋理來命名的，如星月菩提、鳳眼菩提等。攜帶一串菩提佛珠，是會給人增福無量的。《佛說較量數珠功德經》說：若菩提子為數珠者，或用掐念，或但手持，數誦一遍，其福無量。
正因為菩提子有如此深遠的含義，因此通常將許多的佛珠皆命名為菩提，而信仰佛教者必有一串菩提佛珠。
(二)寶玉石類
寶石，因其顏色鮮艷、質地晶瑩、光澤燦爛、堅硬耐久，而又存世稀少，故較為貴重。一般來講，比較常見的寶石種類有：水晶、橄欖石、木變石、綠松石、孔雀石、芙蓉石、東陵石、青金石、碧璽、石榴石、金沙石等諸多品類。但這些只能算是次等寶石，遠遠比不上金剛石、紅寶石、藍寶石、祖母綠這四大名貴寶石，因這些寶石異常珍貴，故用這些寶石來製造佛珠，多為皇室或富紳所持用，一般人是無法得到的。如在《虛雲老和尚年譜》一書中，便有關於虛雲老和尚委託寬航法師將某親王所贈的「七色九寶羅漢珠」一串，帶到香港交給岑學呂居士留念的記載。
玉石，有廣義與狹義之分。就廣義而言，包括許多種用於工藝美術雕琢的礦物和岩石。諸如大理石、壽山石、青田石、昌化石、巴林石、端硯石等均屬此範疇。而狹義上講，玉石僅指硬玉(以緬甸優質翡翠為代表)和軟玉(以優質和田玉為代表)二種。由於千百年來，玉石象徵吉祥，傳說可以避邪、禳災和帶來幸運，以及受到「君子比德如玉，有仁、智、禮、忠、信之道」的影響，那些採用玉石製造的佛珠，也就越發受到人們的喜愛了。
(三)果實(核)類
果實(核)類佛珠，在佛珠的大家庭中占有很大比例。人們隨便就可以列舉出不少種類，桃核雕刻、核桃雕刻、橄欖核雕刻、皤桃核、金剛子、太陽子、天薏子、蓮子、椰蒂、五眼六通等，簡直不勝枚舉。這其中以桃核、橄欖核為果核類的代表，以木槵子、椰殼(蒂)為果實類的代表。
桃樹是一種落葉喬木，易植而子繁，故被人們廣泛種植。據傳桃木可以驅鬼，桃梗可能禳惡，桃符可以辟邪，而桃核堅硬，可以用來雕刻成具有深刻含義的各類佛珠。
橄欖是一種常綠喬木，果實長圓而兩頭尖，因其味苦澀而甘，故有「諫果回甘」之稱。橄欖核堅硬如石，是製造佛珠的極佳材料。
木槵子，亦稱作無患子，是一種生長在高山上的喬木，枝葉如椿樹，其葉對生，初夏之季開黃色小花，其蒴膨大，裂而為三。結實大如彈丸，堅黑如漆珠。因在《木槵子經》中佛陀曾教導波流離王貫穿木槵子作念珠，遂使得後世的佛教徒均喜用木槵子來製造佛珠，意喻秉承佛陀教誨，無有忘失。
椰，或作「枒」，是一種生長在熱帶地區的常綠喬木。果實叫椰子，可用來製造佛珠。據清代袁枚《隨園詩話》中說：「近來習尚，丈夫多
臂纏金鐲，手弄椰珠……。」趙棻在《濾月軒文集》中亦有相同的記載：「乾隆年間，戶部侍郎趙秉沖，精選一串椰子數珠，珍比千狐之腋。」由此可知用椰殼(蒂)來製造佛珠在清初已很普遍，有數百年的歷史了。
(四)竹木類
竹和木都可以用來製造佛珠。竹是一種多年生長的禾本木質常綠植物，柔體而虛中，不易被風雨所摧折，經歷寒暑，枝葉蒼翠不凋，故而古人常把它比作是「臨大節而不可奪」之君子。竹有篁竹、邛竹、文竹、箭竹、棕竹、桃枝竹、斑皮竹等類。篁竹，質堅皮白;邛竹，高節實中;箭竹，堅勁中矢，這些都是用來製造佛珠的好材料。
至於木的種類，可以說是不可勝數。用來製造佛珠的一般材質，可用松、柏、桂、椒、桐、梓等，因為松柏後凋，比喻堅貞、壽考;桂椒馥郁，表示拔萃通神;桐為嘉木，鳳凰可棲;梓是良材，用制琴瑟，大都具有一定的含義。但是，比較名貴的木製佛珠，則多選用檀香、沉香、伽南、烏木等珍貴質料。
檀香木，又名旃檀，能作香料焚燒，亦可入藥。如《一切經音義》中注釋說：旃檀，謂白檀能治熱病，赤檀能去風腫，皆是除疾安身之藥，故名與樂。
時至今日，用來製造佛珠的檀木，以黃檀和紫檀居多。尤其是紫檀，因其木材堅實，紋理細密，色澤紫紅，加之有馥郁的香氣，被列為佛教五香(瀋水香、白檀香、紫檀香、娑羅香、天木香)之一，更為人們所鍾愛。
(五)其它種類
這一項的涵蓋面非常廣泛。可以說，除了上述的珍寶類、菩提類、寶玉石類、果實(核)類、竹木類之外，皆應屬於此項。牛角、牛骨、犀角、象牙等由於律制所限，一向被漢傳佛教所排斥，卻深受藏傳佛教的喜愛，藏傳佛教甚至還有用人頭骨來製造佛珠的，佩帶或持用這些佛珠，也就更能使人了知生死的本來。同時，還會使人感受到一些神秘的宗教氣氛。
除此之外，還有用陶瓷、紫砂、雕漆等質料做成的佛珠，這些形態各異的佛珠，也同樣會帶給人們無盡的遐思。
五、加功用行——佛珠的持用方法
佛珠是弘法最為方便的法器，所以歷來大德高僧莫不巧用佛珠。在經典當中特彆強調，持用不同質料的佛珠，其念誦的功德利益，也有勝劣的差異。如《佛說較量數珠功德經》中，佛告大眾言：汝等善聽，我今演說受持數珠校量功德獲益差別。若有誦念諸陀羅尼及佛名者，為欲自利及護他人，速求諸法得成驗者，其數珠法應有如是，須當受持：若用鐵為數珠者，誦掐一遍得福五倍;若用赤銅為數珠者，誦掐一遍得福十倍;若用真珠、珊瑚等為數珠者，誦掐一遍得福百倍;若用木槵子為數珠者，誦掐一遍得福千倍，若求往生諸佛淨土及天宮者，應受此珠;若用蓮子為數珠者，誦掐一遍得福萬倍;若用因陀羅佉叉為數珠者，誦掐一遍得福百萬倍;若用烏盧陀羅佉叉為數珠者，誦掐一遍得福千萬倍;若用水精為數珠者，誦掐一遍得福萬萬倍;若用菩提子為數珠者，或用掐念，或但手持，數誦一遍其福無量，不可算數，難可校量。
此外，在《攝真實經·建立道場發願品》卷下、《守護經》、《瑜伽念珠經》中，均以菩提子珠的功德最為殊勝。那麼人們不禁要問：為什麼菩提子珠具有如此大的功德呢?在《曼殊室利咒藏校量數珠功德經》裡邊，文殊菩薩為大眾講述了佛陀往昔因地當中的一段故事，以釋群疑：以何因緣我今偏贊用菩提子獲益最勝?曼殊室利菩薩言：乃往過去有佛出世，在此樹下成等正覺。時一外道，邪見壞心，毀謗三寶。彼有一男，忽被非人之所打殺。外道念言：我今邪見，未審諸佛有何神力。如來今既在此樹下成等正覺，若其實聖，樹應有感。即將亡子臥菩提樹下，作如是言：佛樹若聖，我子應蘇。以經七日，誦念佛名，子乃重蘇。外道歡喜贊言：諸佛有大神力我未曾見，佛成道樹現此希奇甚大威德，難可思議。時諸外道聞此事已，舍邪歸正，發大菩提心，信佛神力不可思議。以此因緣，世人皆號為延命樹。其菩提樹遂有二名：一名菩提樹，二名延命樹。
不管怎樣說，選擇一串菩提子的佛珠，在心中念誦經文、咒語或佛菩薩的聖號，可以驅除煩惱，消除報障，增加智慧，利己護人，對於幫助我們修行實在是大有裨益。
前面講過，佛珠可分為三個種類，即持珠、佩珠、掛珠，而一般的念佛者，大多選用持珠。持珠的姿勢，亦可分為二種，單手持珠與雙手持。單手持珠，大多用於站立、經行的時候;而雙手持珠則是打坐時經常採用的姿勢。其方法是將佛珠置於兩手之間，呈交叉狀，把母珠放在一側，掐捻一周，回至原處即可。其實，根據《佛像圖鑑》一書記載，歷來大德高僧手持佛珠的姿勢皆無定法，左手、右手、單手、雙手、提高、垂下、平胸、齊膝，各種動作都有，但求其「方便」而已，所以我們也就不必強求特定的持珠方法了。
在持珠的過程中，經常有人會遇到要不要跨過「佛頭」(母珠)這類問題。因為在經典中曾有：
珠表菩薩之勝果，於中間絕為斷漏。
繩線貫串表觀音，母珠以表無量壽。
慎莫驀過越法罪，皆由念珠積功德。
經有記載，故而才有此一說。假如念誦者，純以佛珠作為記數的工具，則不必把母珠和隔珠計算在內，念誦時輕輕捻過便是。如是念誦的人，除了把佛珠當作精進、記數的工具外，還希望藉著它來體悟更多佛理的話，當手捏到隔珠的時候，可用「佛、法、僧」三寶，或「戒、定、慧」三學來觀想，當手掐到母珠的時候，也同樣可以觀想佛的相好光明，同時再逆時針朝相反方向捏念，即可解決此類問題了。
佛珠除了拿在手中起念誦記數的作用以外，還可以掛在頸部充當掛珠，或纏繞在手臂上起到佩珠的作用，這些都是具有深刻含義的：
二手持珠當心上，靜慮離念心專注，
本尊瑜伽心一境，皆得成就理事法。
設安頂髻或掛身，或安頸上及安臂，
所說言論成念誦，以此念誦淨三業。
由安頂髻淨無間，由帶頸上淨四重，
手持臂上除眾罪，能令行人速清淨。
若修真言陀羅尼，念諸如來菩薩名，
當獲無量勝功德，所求勝願皆成就。
再者，密教中由於三部(胎藏界)、五部(金剛界)修法之不同，對於佛珠也有著特殊的要求，與平時常用的佛珠相比，是有所不同的。據《蘇悉地羯羅經》說：「佛部用菩提子珠，觀音部用蓮花子珠，金剛部用嚕椰羅叉子珠。」又據《守護經》及《瑜伽念珠經》說：「佛部用菩提子珠，金剛部用金剛子珠，寶部用金等諸寶珠，蓮花部用蓮花子珠，羯磨部用種種和合珠。」又近人金安一居士所著《密宗輯要》一文說：「修增法用琥珀珠，修息法用水晶珠，修壞法及長壽法用珊瑚珠，修誅法用人頭骨珠，修觀音法用菩提子珠，修一切法均可用鳳眼菩提子珠。」
另外，密教的經典對掐捻佛珠的指法也有詳細規定。從五部而言，《攝真實經》中記載：佛部以右手拇指與食指掐之，金剛部以右手拇指與中指，寶部以右手拇指與無名指，蓮花部以右手拇指與小指，羯磨部以右手拇指與其餘四指合捻之。從三部而言，《蘇悉地經》中記載：佛部以右手拇指與其餘四指的指尖相合，中指與小指直立，食指略屈附於中指中節以掐之;蓮花部以拇指與中指指尖相合，舒展其餘三指而掐之;金剛部以拇指與食指指尖相合，舒展其餘三指而掐之。
隨喜