密宗特彆強調本尊的修法，但修密法需要有顯宗的基礎。所以真正想要修本尊，成就本尊，必須要具有出離心、菩提心和證悟空性的智慧。在此基礎上，由上師領你進入壇城，給你灌頂，給你傳授修本尊的儀軌，然後通過儀軌，通過兩個次第，如理如法地修本尊，才能成就。
本尊就是與你有緣的佛菩薩。他是諸佛的總體，所有的佛菩薩、空行護法，都是從他那裡幻化的。無論你修哪個本尊，最後都要歸到自己的本尊那裡，無論你修哪一尊都是他的幻化。比如你的本尊是金剛薩垛佛，但是你現在念阿彌陀佛，那麼阿彌陀佛就是金剛薩垛佛的化身，你念的就是金剛薩垛佛。在你念本尊金剛薩垛佛的時候，也是念阿彌陀佛、念蓮花生大士、念觀音菩薩。念一尊也是念一切，念一切也是念一尊，他是三世諸佛之總體，所以就叫本尊。如果你的修行沒有這麼高的層次，沒有這麼高的見解，你根本沒有本尊。如果你能將一個當成一切，將一切歸為一個，能夠這樣學修，那才是有本尊了。
所有的具德上師都是一體的，所有的本尊都一體的。所以沒有必要去分別。如果擔心：我今天只念了蓮花生大士和金剛薩垛佛，沒念觀音菩薩和阿彌陀佛，怕他們兩個不高興，然後就去念。這都是分別，沒有必要。我們講金剛薩垛的時候，說他是三世諸佛的總體，是一切壇城的主尊；講蓮花生大士的時候也是，說他是三世諸佛的總體，一切本尊的總集，一切壇城的主尊；講阿彌陀佛的時候也是這樣講的。到底誰是主尊？到底誰是總體？都是主尊、都是總體。為什麼化現那麼多尊呢？這是根據眾生的因緣意樂而化現的，也是緣起性空的一種作用。本尊實際上也是空性的，是諸法的本性。所有的這些佛菩薩，都是從他那裡生的，最後歸到他那裡滅。
很多人覺得自己修密法了就特別著急想修本尊，想知道自己的本尊是哪位佛。你想修本尊沒有錯，但要有出離心、菩提心以及般若空性智慧，在這個基礎上再觀修本尊，這才是如法的。如果目前還沒有空性的見解，就急著修本尊，那就是在肓修瞎練，不但不會有任何成就，還很容易變成鬼神、惡魔。這種鬼魔跟一般的鬼神不一樣，傷害眾生的力量非常強，而且很難降伏。
所以，進入密乘要有一定的基礎，需要相續成熟，否則你無法能夠進入密乘，無法能夠接受灌頂，無法能夠通過兩個次第修持本尊，最終也無法能夠成就本尊。進入密乘以後，通過生起次第和圓滿次第來修本尊，不離三種三摩地（等持）：真如等持、顯位等持、因位等持。真如等持就是大空性，有證悟大空性的智慧；顯位等持是盡虛空遍法界的大慈大悲，和空性無二的大悲之心；因位等持是從空性中，以大悲心來顯現的諸佛、諸本尊的種子字，通過種子字展現本尊以及眷屬。在這裡面觀這些種子字和本尊就是生起次第，圓滿次第就是大空性的智慧。
證悟大空性的智慧，不是誰都可以做到的，所以大家不要著急。我們明白了修持的次第和過程，把基礎打好了，再去修本尊，或者通過上師的竅訣直接修大圓滿都可以，這樣修起來也特別容易。而且這個時候念佛求往生也一定能往生，打坐修禪，持咒修本尊也一定會得到成就的。所以說，你可以修本尊，但是一定要按次第，按儀軌，按方法去修。