修持一切法門都要有三個殊勝的攝持：前行發心殊勝，正行無緣殊勝，後行回向殊勝。
我們為什麼要修持金剛薩垛法門?不是為了自己，也不是為了某某眾生，而是為了修持成佛，成佛以後度化一切父母眾生。這是前行發心殊勝，發菩提心。
然後是正行。觀修金剛薩垛、念誦百字明的整個過程要用證悟空性的智慧來攝持，觀三輪體空。
第一個體，是我們所觀想的對境，上師金剛薩垛佛;
第二個體，是我們所修的法，金剛薩垛除障法;
第三個體，是修行者自己。
將這三輪觀為空，觀性空妙有;都是真空的，但也是妙有的。
金剛薩垛怎麼會在空中?自己的上方為什麼能出現上師金剛薩垛?為什麼能降下許多甘露，能消除所有的業障?都是因為性空，所以才有妙有。你要相信這個道理、有這種智慧才能觀。如果有懷疑，都觀為真實真相，都是那麼粗大的物質是不行的。
這個過程中需要正行無緣，正行無緣是不執著。一切都要觀為性空，性空才有妙有，妙有才有性空，這些都是不可思議的。你相信不可思議，你懂得了不可思議的道理，才有不可思議的因果，才能降下甘露，才能消除業障，才能得以清淨。因為都是性空，才有妙有;因為妙有，才有這些結果。
最後是後行回向殊勝。現在很多人總是回向給某某人，這樣不圓滿。我們為了什麼念修金剛薩垛?是為了早日修持成佛，成佛之後是為了救度眾生。我們無論什麼時候都不應該忘記一切父母眾生，回向的時候也應該回向給一切眾生，願自己所做的功德、所積的福德、所種的善根，都成為一切眾生解脫、成佛的因緣。
我們回向的對境是無量的，回向的功德也是無量的，這是使功德得以圓滿的一種方法，一種善巧方便;回向的對境大，自己得到的功德就多。為自己、為某某眾生回向，你得到的功德就特別的小，因為你的對境小、心量小。首先是皈依，要真正有皈依上師三寶的決心。然後是發菩提心，要有度化無量眾生的廣大願心。還有，要懂得輪迴的過患，並深信因果不虛的道理。這些都是最基本的修法。