懺悔時，意念的專注非常重要，如果一邊口念懺悔文，心卻散亂地想其他事情;或是認為現在先懺悔，以後再造業也沒有關係，這樣的懺悔就沒什麼意義了。懺悔時，應具足四種對治力，才能徹底淨化罪業：
一、所依對治
懺悔時，所依靠的殊勝對境，就是所依對治，又分為外在所依和內在所依。所依對治力的關鍵，是堅定不移的信心。
1.外在所依
外在所依有很多，比如佛法僧三寶的象徵———佛塔、佛經、佛像。還有懺悔的法門，像《三十五佛懺悔文》、《八十八佛懺悔文》，漢傳佛教里還有修《慈悲三昧水懺》、《梁皇寶懺》等等。或是每天清晨剛露出曙光時，向虛空藏菩薩懺悔業障，這些都是懺悔時的所依對治。
2.內在所依
不論修哪一種懺悔法門，都要具備願菩提心和行菩提心，這是內在所依。如果沒有菩提心，就算有四種對治力，也只能稍微減少一點罪業，而不能完全清淨。因為無始以來我們所造的罪業，是以外在眾生為對象而積累的，因而要淨除罪障，也要依賴利益眾生來消除。若不明白業力的可怕，它就會一直傷害你，一旦明白時，它就無處躲藏。我們現在還無法靠自己完全清淨業障，但只要具有菩提心，在一剎那中，就可以消除多生累劫的罪業。《入菩薩行論》中說：「菩提心如劫末火，剎那能毀諸重罪。」
而金剛薩埵法門的外在所依，是金剛薩埵佛;內在所依，是皈依和菩提心。懺悔時，在皈依發心之後，就以金剛薩埵作為皈依境。這就像走在暗夜的曠野中，有一個勇者和我們同行一樣。只要心中有真正的所依，就有勇氣戰勝恐懼，包括已知或未知的恐怖。而且我們現在依賴的，不是凡夫，而是足以完全託付，已經究竟解脫、圓滿成就的佛。
二、厭患對治
厭患對治，是對過去的不善之行，承認錯誤，生起強烈後悔和厭離之心。如果不承認自己所作所為是不正確的、惡劣的，不是很想改過，就不是真心懺悔，當然不能清淨業障。所以，厭患對治力的關鍵，是後悔心。
一個人服了毒藥，毒性發作時會疼痛難忍，一定會後悔吃了毒藥。而我們以往所造的罪業，殺生、偷盜、妄語等，比毒藥更厲害，果報更可怕。同樣的，沒有後悔心的懺悔，怎麼懺悔都很難起作用，只會在惡業中越陷越深，無法自拔;必須要害怕因果，厭離一切惡行，業障才會清淨。雖然有的罪業自己很清楚，有些罪業自己並不知道，但都要一起懺悔。
三、約束對治
約束對治，是發誓從懺悔的即刻起，下決心徹底改過，對過去所做的惡行，縱使遇到生命危險，也絕不會再犯。所以，約束對治力的關鍵，是戒後心，就是戒除以後再犯之心。
當然，我們還不是菩薩，無法相信自己從今以後不會再造惡業。如果要求你今天懺悔全部罪業，不要再貪，不要再嗔，不要再嫉妒、傲慢，也許可以維持一、兩天;可是要你保證從今天起，絕對不會再犯，可能嗎?就像吸毒的人想戒毒，為了治病而克制自己，可以暫時不吸毒;但是當毒性發作得厲害時，要他絕不再犯，就很不容易了。
所以，懺悔時，要把握的是懺悔的當下，而不必去憂心未來。最重要的是發自內心深處，發誓絕對不再造作這些惡業。有了這樣的決心，即使無法完全斷除，至少會有一定的約束力。這樣一點一滴去修，未來慢慢就不會再犯了。
四、現行對治
現行對治，是約束惡行以後，盡力去做對治罪業的一切善行。比如，頂禮諸佛、隨喜功德、普皆回向，修持願行菩提心、安住實相等等善業。所以，現行對治力的關鍵，是對正法產生希求心。
要淨除過去的罪業最好的方法，莫過於修菩提心和護持法性實相。以前，有一位曾經以販售佛經維生的人，對這樣的行為深感後悔，於是去請教岡波巴大師，大師教他印造佛經來懺悔。可是他在印造經書時，心思十分散亂，他又去請示大師：「我印造經書時，心念非常散亂，無法清淨。我想，真正要懺悔業障，應該沒有比護持法性實相更深奧的法門吧?」岡波巴大師很高興地說：「的確是如此。縱使過去的罪業堆積如山，也可以在見性時，得到完全的清淨。」
如果是利根者，安住在三輪體空，也就是沒有能懺、所懺、懺法的境界，也是懺悔。但一般來說，淨除業障最有效的藥方，就是在菩提心的基礎上，修持金剛薩埵。
再好的法門，聽聞之後一定要實修，才會有用。光聽不修，妙法似乎和他就沒多大關係了。就像去醫院看病，聽完醫生分析病情，知道了病因，拿了藥，回家卻把藥放在抽屜不去服用一樣。
以前，我的上師有個師兄，到寧瑪派著名的佐欽佛學院讀書。有人問他：「聽說《俱舍論》非常難懂，你認為如何?」雖然他已經學很久了，卻說：「我不知道，上師講過很多遍，至於難不難懂、辛不辛苦，是書裡的事，和我沒關係!」
如果大家修行懺悔也是這樣，我講歸講，你們聽歸聽，觀想歸觀想，罪業歸罪業，回家以後還是不修，對講課的我是比較沒有關係，但要對治你們的業障，是沒什麼效用的，所以要時時提醒自己下工夫實修。
聽過的佛法，如果好好用心學習，深入理解，持之以恆，百分之百會對身心的安頓有幫助，更不用說對來世解脫的助益了，這是真實不虛的。