斷煩惱要靠智慧，這是唯一的方法，神通、神變解決不了問題。
什麼是智慧?證悟無我、證悟空性的智慧才是真正的智慧。只有用它來對治，才能徹底地斷掉煩惱。這樣煩惱斷掉後就再也不會生起來了，而我們總是斷不掉，還是因為自己沒有智慧。
其實你一觀察，煩惱的自性是空的，是不可得的。這些煩惱沒有在色法等外境中，沒有在耳根等內在的根中，也沒有在精神和肉體(物質)中間。也就是說，它不在外邊，也不在裡面，也不在中間，所以煩惱是不可得的。你到外境上去找煩惱，找不到;然後在內在身心裏面一步步地去找: 頭髮、頭、手腳、心臟……都找不到。向裡面找不到，向外面也找不到，里外的中間處也找不到，所以煩惱是不可得的。它如幻如夢，和夢境幻術一樣，根本就不存在自性。它顯而無自性，看似有，實際不存在。如果你真正找到了煩惱的自性，從中能安住的話，那你當下就能息滅一切煩惱。
其實，煩惱本身也是菩提，因為煩惱也是空性的。煩惱看似有，實際上沒有，這是「顯而無自性」，即大空性。煩惱生起來時，可以去觀察它的自性，尋找它的實體，然而找不到。經過觀察可以得知，煩惱不是事實存在的，也是如幻如夢的。
既然煩惱如同幻術，它的自性根本就不存在，所以沒有必要對它心存畏懼。它好像很可怕似的藏在我們心裡，加害我們，但是若以智慧去觀察的話，它也如幻如夢，因此沒有必要去害怕它。
斷煩惱是要靠智慧的。依靠智慧，煩惱並不可怕，以智慧精進修行很容易就可以擺脫煩惱。
若煩惱沒有了，輪迴也就沒有了，也不用遭受地獄的痛苦了。現在看起來斷煩惱這麼簡單，我們為什麼還要聽這些煩惱的，還要遭受這些無意義的痛苦呢?不應該啊!
若是好好以智慧去對治，煩惱也是很容易斷掉的。所以大家清醒一點，智慧一點，不要再去遭受這些無意義的痛苦了!
——摘自《入菩薩行論》講記25